MirGeneDB 3.0
362 Danio rerio microRNA genes
Sort by genome coordinates Motifs Tissue expression
- +
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) Iso­miR 3' NTU  UG  UGUG CNNC Br Br Em Ey Gu Gu He Li Li Ov Te
Dre-Let-7-P1b1 dre-let-7d-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001762 MIMAT0031931 chr16 24881136 24881205 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Let-7-P1b2 dre-let-7d-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001762 MIMAT0031931 chr19 9429867 9429936 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Let-7-P1c1 dre-let-7c-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001761 MIMAT0031930 chr15 29795845 29795911 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P1c2 dre-let-7c-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001761 MIMAT0031930 chr10 38072088 38072154 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P1d1 dre-let-7a-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr15 21437886 21437952 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P1d2 dre-let-7a-4 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr5 29990466 29990532 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P2a1a dre-let-7a-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr11 27503240 27503310 - Clupeocephala Bilateria Yes 1 1
Dre-Let-7-P2a2a dre-let-7a-3 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr4 18654173 18654244 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P2a2b None LET-7 GAGGUAG None None chr25 2189978 2190049 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P2a3a dre-let-7g-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001765 None chr23 28536374 28536444 + Clupeocephala Bilateria Yes 1 1
Dre-Let-7-P2a3b dre-let-7g-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001765 None chr23 18382469 18382538 - Clupeocephala Bilateria Yes 1 1
Dre-Let-7-P2a4a dre-let-7e LET-7 GAGGUAG None None chr23 5431431 5431503 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2a4b None LET-7 GAGGUAG None None chr6 54507105 54507176 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b1a dre-let-7f LET-7 GAGGUAG MIMAT0001764 None chr11 27503037 27503113 - Clupeocephala Bilateria Yes
Dre-Let-7-P2b2a dre-let-7b LET-7 GAGGUAG MIMAT0001760 None chr4 18653156 18653231 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b2b None LET-7 GAGGUAG None None chr25 2192692 2192767 + Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b3a dre-let-7h LET-7 GAGGUAG MIMAT0001766 None chr23 28536683 28536763 + Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b4a dre-let-7a-5 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr23 5431216 5431292 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b4b dre-let-7a-6 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr6 54506483 54506558 - Clupeocephala Bilateria Yes 1 1
Dre-Let-7-P2c2b dre-let-7i LET-7 GAGGUAG MIMAT0001767 None chr25 1629663 1629739 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2c3 dre-let-7j LET-7 GAGGUAG MIMAT0003015 None chr6 41454794 41454872 + Gnathostomata Bilateria Yes 1 1
Dre-Mir-1-P1 dre-mir-1-2 MIR-1 GGAAUGU None MIMAT0001768 chr2 4116326 4116387 - Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-1-P2a dre-mir-206-1 MIR-1 GGAAUGU MIMAT0031988 MIMAT0001866 chr20 19544667 19544726 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-1-P2b dre-mir-206-2 MIR-1 GGAAUGU None MIMAT0001866 chr17 5967262 5967321 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-1-P3 dre-mir-1-1 MIR-1 GGAAUGU None MIMAT0001768 chr23 7210180 7210240 - Gnathostomata Bilateria No
Dre-Mir-7-P1a dre-mir-7a-1 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001266 None chr25 12472469 12472532 + Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-7-P1b dre-mir-7a-2 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001266 None chr7 14450544 14450608 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-7-P2b dre-mir-7b MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001265 None chr5 55607762 55607825 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-7-P3 None MIR-7 GGAAGAC None None chr16 45902460 45902524 + Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-7-P4b dre-mir-7a-3 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001266 None chr8 10232 10295 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-8-P1a dre-mir-200b MIR-8 AAUACUG MIMAT0031985 MIMAT0001862 chr23 24072041 24072100 + Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-8-P1b dre-mir-200c MIR-8 AAUACUG MIMAT0031986 MIMAT0001863 chr6 40656216 40656274 - Vertebrata Nephrozoa No 1 1 1
Dre-Mir-8-P2a dre-mir-200a MIR-8 AACACUG MIMAT0031984 MIMAT0001861 chr23 24072173 24072233 + Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-8-P2b dre-mir-141 MIR-8 AACACUG MIMAT0031974 MIMAT0001837 chr6 40656013 40656073 - Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-8-P3a dre-mir-429a MIR-8 AAUACUG None MIMAT0001624 chr23 24073828 24073886 + Vertebrata Nephrozoa No 1 1
Dre-Mir-8-P3b dre-mir-429b MIR-8 AAUACUG None MIMAT0011291 chr6 40653151 40653208 - Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-9-P1a dre-mir-9-3 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr25 8551263 8551322 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-9-P1b dre-mir-9-6 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr7 14379556 14379617 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P2a dre-mir-9-2 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr10 43535995 43536054 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P2b dre-mir-9-5 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr5 48170110 48170169 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-9-P3a dre-mir-9-1 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr16 29216288 29216349 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P4a dre-mir-9-4 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0031932 chr22 18254783 18254842 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P4b dre-mir-9-7 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0031933 chr2 59102181 59102239 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-10-P1b1 V dre-mir-10b-1 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001268 MIMAT0031919 chr9 1952963 1953024 - Clupeocephala Eumetazoa 2 No 1 1
Dre-Mir-10-P1b2 V dre-mir-10d MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001771 MIMAT0003394 chr6 10867051 10867112 + Clupeocephala Eumetazoa 2 No 1
Dre-Mir-10-P1c1 V dre-mir-10c MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001770 MIMAT0031935 chr3 23720666 23720728 + Clupeocephala Eumetazoa 2 No 1
Dre-Mir-10-P1c2 V dre-mir-10a MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001267 MIMAT0003391 chr12 27134886 27134944 + Clupeocephala Eumetazoa 2 No 1 1
Dre-Mir-10-P1d1 V dre-mir-10b-2 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001268 MIMAT0031934 chr23 36130016 36130078 + Clupeocephala Eumetazoa 2 No 1
Dre-Mir-10-P2c1 dre-mir-99-1 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001812 None chr15 29795596 29795654 + Clupeocephala Eumetazoa Yes
Dre-Mir-10-P2c2 dre-mir-99-2 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001812 None chr10 38074322 38074380 - Clupeocephala Eumetazoa Yes 1
Dre-Mir-10-P2d1 dre-mir-100-1 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001813 MIMAT0031957 chr15 21437656 21437712 + Clupeocephala Eumetazoa No 1 1 1
Dre-Mir-10-P2d2 dre-mir-100-2 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001813 MIMAT0031958 chr5 29990157 29990213 + Clupeocephala Eumetazoa No 1 1 1
Dre-Mir-10-P3b1 dre-mir-125a-1 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001820 None chr16 24898184 24898242 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3b2 dre-mir-125a-2 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001820 None chr19 9443800 9443858 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3c1 dre-mir-125c MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001822 MIMAT0031966 chr15 29800981 29801041 + Clupeocephala Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P3c2 dre-mir-125b-3 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001821 MIMAT0031965 chr10 38051674 38051736 - Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3d1 dre-mir-125b-1 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001821 MIMAT0031963 chr15 21447701 21447762 + Clupeocephala Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P3d2 dre-mir-125b-2 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001821 MIMAT0031964 chr5 29998775 29998836 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-15-P1a1 dre-mir-15a-1 MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001772 MIMAT0003395 chr1 46722633 46722692 - Clupeocephala Olfactores No
Dre-Mir-15-P1a2 dre-mir-15a-2 MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001772 None chr9 29652531 29652588 - Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P1b dre-mir-15c MIR-15 AGCAGCG MIMAT0003764 None chr15 1543699 1543757 + Gnathostomata Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P1d dre-mir-15b MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001773 MIMAT0031936 chr7 26070912 26070973 + Gnathostomata Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2a1 dre-mir-16b MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001775 None chr1 46722416 46722480 - Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2a2 dre-mir-16c MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001776 MIMAT0031937 chr9 29652389 29652453 - Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2b dre-mir-16a MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001774 None chr15 1543869 1543933 + Gnathostomata Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2c V dre-mir-457b MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001884 MIMAT0032004 chr14 31521938 31521997 - Gnathostomata Olfactores 2 No 1
Dre-Mir-15-P2d dre-mir-457a MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001883 None chr7 26071436 26071500 + Gnathostomata Olfactores No 1
Dre-Mir-17-P1a1 dre-mir-17a-1 MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001777 MIMAT0003396 chr1 3298149 3298209 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P1a2 dre-mir-17a-2 MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001777 MIMAT0031938 chr9 53436955 53437013 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P2a1 dre-mir-18a MIR-17 AAGGUGC MIMAT0001779 None chr1 3298014 3298078 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-17-P2a2 dre-mir-18b MIR-17 AAGGUGC MIMAT0001780 MIMAT0003397 chr9 53436841 53436905 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-17-P2c dre-mir-18c MIR-17 AAGGUGC MIMAT0001781 None chr14 31467386 31467450 - Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P4a1 dre-mir-20a MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001786 MIMAT0003400 chr1 3297646 3297705 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P4a2 None MIR-17 AAAGUGC None None chr9 53436542 53436606 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P4c dre-mir-20b MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001778 MIMAT0031939 chr14 31467183 31467241 - Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-17-P4d dre-mir-93 MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001810 None chr14 100511 100568 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-19-P1a1 dre-mir-19a MIR-19 GUGCAAA MIMAT0003398 MIMAT0001782 chr1 3297862 3297919 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-19-P1a2 None MIR-19 GUGCAAA None None chr9 53436701 53436758 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-19-P2a1 dre-mir-19b MIR-19 GUGCAAA MIMAT0003399 MIMAT0001783 chr1 3297494 3297555 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-19-P2a2 None MIR-19 GUGCAAA None None chr9 53436416 53436475 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-19-P2c dre-mir-19c MIR-19 GUGCAAA MIMAT0031940 MIMAT0001784 chr14 31467045 31467105 - Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-19-P2d dre-mir-19d MIR-19 GUGCAAA MIMAT0031941 MIMAT0001785 chr14 100674 100734 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-21-P1 dre-mir-21-1 MIR-21 AGCUUAU MIMAT0001787 None chr10 28198933 28198993 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-21-P2 dre-mir-21-2 MIR-21 AGCUUAU MIMAT0001787 None chr15 17373822 17373880 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-22-P1a dre-mir-22b MIR-22 AGCUGCC MIMAT0031943 MIMAT0001789 chr5 12610815 12610873 + Vertebrata Bilateria No 1 1
Dre-Mir-22-P1b1 dre-mir-22a MIR-22 AGCUGCC MIMAT0031942 MIMAT0001788 chr15 24908404 24908466 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-22-P1b2 None MIR-22 AGCUGCC None None chr21 39267231 39267293 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-23-P1 dre-mir-23a-3 MIR-23 UCACAUU MIMAT0031945 MIMAT0001790 chr2 33900445 33900503 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-23-P2a dre-mir-23b MIR-23 UCACAUU None MIMAT0001791 chr10 15954588 15954651 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-23-P2b dre-mir-23b-2 MIR-23 UCACAUU MIMAT0048660 MIMAT0048661 chr8 30167636 30167695 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-23-P3 dre-mir-23a-2 MIR-23 UCACAUU MIMAT0031944 MIMAT0001790 chr3 13406243 13406303 + Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-23-P4a dre-mir-23a-1 MIR-23 UCACAUU None MIMAT0001790 chr22 5293226 5293289 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-24-P1 dre-mir-24b MIR-24 GGCUCAG MIMAT0048662 MIMAT0048663 chr2 33905775 33905834 + Gnathostomata Vertebrata Yes
Dre-Mir-24-P2a dre-mir-24-1 MIR-24 GGCUCAG None MIMAT0001792 chr10 15960847 15960904 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-24-P2b dre-mir-24-3 MIR-24 GGCUCAG None MIMAT0001792 chr8 30162533 30162590 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-24-P3 dre-mir-24-2 MIR-24 GGCUCAG None MIMAT0001792 chr3 13412992 13413050 + Gnathostomata Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-24-P4a dre-mir-24-4 MIR-24 GGCUCAG None MIMAT0001792 chr22 5307502 5307561 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-26-P1a dre-mir-26a-3 MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001794 None chr24 20470992 20471052 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-26-P1b dre-mir-26a-2 MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001794 MIMAT0031948 chr2 21375503 21375560 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-26-P2a dre-mir-26a-1 MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001794 MIMAT0031947 chr9 41733543 41733602 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-26-P4 dre-mir-26b MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001795 None chr23 24675224 24675284 - Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-27-P1 dre-mir-27a MIR-27 UCACAGU MIMAT0031949 MIMAT0001796 chr2 33902361 33902423 + Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-27-P2a dre-mir-27d MIR-27 UCACAGU None MIMAT0001799 chr10 15954740 15954804 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-27-P2b dre-mir-27b MIR-27 UCACAGU MIMAT0031950 MIMAT0001797 chr8 30167449 30167508 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-27-P3 dre-mir-27c MIR-27 UCACAGU MIMAT0003401 MIMAT0001798 chr3 13406464 13406527 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-27-P4a dre-mir-27e MIR-27 UCACAGU None MIMAT0001800 chr22 5299972 5300035 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-29-P1b1 dre-mir-29b-2 MIR-29 AGCACCA None MIMAT0001801 chr4 11608208 11608269 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-29-P1d1 dre-mir-29b-1 MIR-29 CUGAAUU None MIMAT0001801 chr6 47467922 47467983 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-29-P1d2 dre-mir-29b3 MIR-29 AGCACCA MIMAT0048667 MIMAT0048668 chr23 32440125 32440189 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-29-P2b1 dre-mir-29a MIR-29 AGCACCA None MIMAT0001802 chr4 11606782 11606841 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-29-P2d2 None MIR-29 AGCACCA None None chr23 32439975 32440034 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-30-P1a dre-mir-30d MIR-30 GUAAACA MIMAT0001806 None chr16 25341450 25341514 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1 1
Dre-Mir-30-P1b dre-mir-30e-2 MIR-30 GUAAACA MIMAT0001807 MIMAT0003402 chr13 27795140 27795201 + Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-30-P1d None MIR-30 GUAAACA None None chr19 42099800 42099865 + Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-30-P1o1 dre-mir-30a MIR-30 GUAAACA MIMAT0001803 MIMAT0031951 chr19 4737589 4737653 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-30-P2a dre-mir-30b MIR-30 GUAAACA MIMAT0001804 None chr16 25341739 25341799 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-30-P2b dre-mir-30c MIR-30 GUAAACA MIMAT0001805 MIMAT0031952 chr13 27804077 27804137 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-30-P2d None MIR-30 GUAAACA None None chr19 42101719 42101778 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-31 dre-mir-31 MIR-31 GGCAAGA MIMAT0003347 None chr7 73263755 73263815 - Bilateria Bilateria No 1
Dre-Mir-33-P1a None MIR-33 AAUGUUC None None LKPD01061375.1 1389 1445 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-34-P1 dre-mir-34a MIR-34 GGCAGUG MIMAT0001269 None chr23 22591076 22591140 + Gnathostomata Bilateria No 1 1
Dre-Mir-34-P2a dre-mir-34b MIR-34 GGCAGUG MIMAT0003346 None chr5 57922533 57922591 - Vertebrata Bilateria No 1
Dre-Mir-34-P2b dre-mir-34c MIR-34 GGCAGUG MIMAT0003759 MIMAT0032011 chr5 57922296 57922352 - Vertebrata Bilateria No
Dre-Mir-92-P1a1 dre-mir-92a-1 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031953 MIMAT0001808 chr1 3297377 3297435 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-92-P1a2 dre-mir-92a-2 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031954 MIMAT0001808 chr9 53436299 53436355 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-92-P1d dre-mir-92b MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031955 MIMAT0001809 chr16 42898443 42898505 + Gnathostomata Bilateria No
Dre-Mir-92-P2c dre-mir-363 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031992 MIMAT0001874 chr14 31466699 31466769 - Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-92-P2d dre-mir-25 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031946 MIMAT0001793 chr14 100779 100838 + Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-96-P1a dre-mir-96 MIR-96 UUGGCAC MIMAT0001811 MIMAT0031956 chr4 15074738 15074801 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-96-P2a dre-mir-182 MIR-96 UUGGCAA MIMAT0001271 MIMAT0001272 chr4 15075668 15075732 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-96-P3a V dre-mir-183 MIR-96 AUGGCAC MIMAT0001273 MIMAT0031921 chr4 15074581 15074642 + Clupeocephala Bilateria 2 Yes 1 1
Dre-Mir-101-P1 V dre-mir-101a MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0001814 chr6 31365458 31365516 + Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1
Dre-Mir-101-P2 V dre-mir-101b MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0001815 chr5 1837176 1837234 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1 1 1
Dre-Mir-103-P1a dre-mir-107b MIR-103 GCAGCAU None MIMAT0011301 chr17 23573143 23573202 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-103-P1b dre-mir-107a MIR-103 GCAGCAU MIMAT0031959 MIMAT0001817 chr12 16960706 16960765 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-103-P2a dre-mir-103 MIR-103 GCAGCAU None MIMAT0001816 chr13 15223311 15223370 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-103-P2b None MIR-103 GCAGCAU None None chr14 44827467 44827526 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-122 dre-mir-122 MIR-122 GGAGUGU MIMAT0001818 None chr21 10881430 10881488 - Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-124-P1a V dre-mir-124-1 MIR-124 AAGGCAC None MIMAT0001819 chr2 26645327 26645385 - Clupeocephala Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-124-P1b V dre-mir-124-3 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr24 24455662 24455720 + Clupeocephala Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-124-P2a V dre-mir-124-2 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr20 38905541 38905601 - Clupeocephala Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-124-P3a V dre-mir-124-5 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr23 17783451 17783510 + Clupeocephala Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-124-P3b V dre-mir-124-6 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031962 MIMAT0001819 chr8 23122788 23122847 - Clupeocephala Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-124-P4 V dre-mir-124-4 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031961 MIMAT0001819 chr17 27402274 27402333 + Gnathostomata Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-126-P2a V dre-mir-126a MIR-126 CGUACCG MIMAT0003157 MIMAT0001823 chr8 11548435 11548494 - Clupeocephala Olfactores 3 No
Dre-Mir-126-P2b V dre-mir-126b MIR-126 CGUACCG MIMAT0011307 MIMAT0011306 chr21 7240249 7240307 - Clupeocephala Olfactores 3 No 1
Dre-Mir-128-P1 dre-mir-128-2 MIR-128 CACAGUG None MIMAT0001824 chr19 42915449 42915507 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-128-P2a dre-mir-128-1 MIR-128 CACAGUG MIMAT0031967 MIMAT0001824 chr22 12374807 12374865 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-128-P2b dre-mir-128-3 MIR-128 CACAGUG MIMAT0048666 MIMAT0001824 chrUn_KN150366v1 5637 5693 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-129-P1a dre-mir-129-4 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0003158 chr25 30176484 30176548 + Clupeocephala Chordata No 1 1 1
Dre-Mir-129-P1b dre-mir-129-2 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0003158 chr7 50287944 50288006 - Clupeocephala Chordata No 1 1
Dre-Mir-129-P2a dre-mir-129-3 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0048649 chr18 10670670 10670735 + Clupeocephala Chordata No 1 1 1
Dre-Mir-129-P2b dre-mir-129-1 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0031968 chr4 19047477 19047542 - Clupeocephala Chordata No 1 1 1
Dre-Mir-130-P1a1 dre-mir-130c-2 MIR-130 AGUGCAA MIMAT0031969 MIMAT0001828 chr5 13288840 13288898 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-130-P1a2 dre-mir-130c-1 MIR-130 AGUGCAA MIMAT0031969 MIMAT0001828 chr10 17453405 17453463 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-130-P1b1 dre-mir-130a MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001826 chr10 33377140 33377202 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-130-P2a1 dre-mir-301b MIR-130 CUUUGAC MIMAT0031990 MIMAT0001871 chr5 13289363 13289425 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-130-P2a2 dre-mir-301c MIR-130 AGUGCAA MIMAT0031991 MIMAT0001872 chr10 17454501 17454563 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-130-P2b1 dre-mir-301a MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001870 chr10 33377012 33377073 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-130-P3a1 dre-mir-454b MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001878 chr5 13296331 13296395 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-130-P3b1 dre-mir-454a MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001877 chr10 33376841 33376905 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-130-P4a1 dre-mir-130b MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001827 chr5 13299343 13299404 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P1a dre-mir-132-1 MIR-132 AACAGUC MIMAT0003403 MIMAT0001829 chr15 25897727 25897789 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P1b dre-mir-132-2 MIR-132 AACAGUC None MIMAT0001829 chr10 35645043 35645103 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P2a dre-mir-212 MIR-132 CCUUGGC None MIMAT0003049 chr15 25897460 25897528 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P2b dre-mir-212-2 MIR-132 CCUUGGC MIMAT0048650 MIMAT0048651 chr10 35644719 35644787 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-133-P1 V dre-mir-133a-1 MIR-133 UUGGUCC MIMAT0003404 MIMAT0001830 chr2 4114133 4114192 - Gnathostomata Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-133-P2a V dre-mir-133b MIR-133 UUGGUCC MIMAT0003405 MIMAT0001831 chr20 19543389 19543448 - Clupeocephala Bilateria 2 No
Dre-Mir-133-P2b V dre-mir-133c MIR-133 UUGGUCC MIMAT0031971 MIMAT0001832 chr17 5962990 5963049 - Clupeocephala Bilateria 2 No
Dre-Mir-133-P3 V dre-mir-133a-2 MIR-133 UUGGUCC MIMAT0031970 MIMAT0001830 chr23 7172131 7172190 - Gnathostomata Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-135-P1 dre-mir-135b MIR-135 AUGGCUU MIMAT0003032 MIMAT0032006 chr8 26005600 26005660 + Gnathostomata Chordata No 1 1
Dre-Mir-135-P2a dre-mir-135a MIR-135 AUGGCUU MIMAT0003348 None chr25 31044133 31044192 - Clupeocephala Chordata No 1
Dre-Mir-135-P4a dre-mir-135c-1 MIR-135 AUGGCUU MIMAT0001833 None chr11 38175079 38175140 - Clupeocephala Chordata No 1
Dre-Mir-135-P4b dre-mir-135c-2 MIR-135 AUGGCUU MIMAT0001833 None chr23 18063203 18063264 - Clupeocephala Chordata No 1
Dre-Mir-137-P1a V dre-mir-137-2 MIR-137 UAUUGCU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr2 20145753 20145811 - Clupeocephala Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-137-P1b V dre-mir-137-1 MIR-137 UAUUGCU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr2 20145753 20145811 - Clupeocephala Bilateria 2 No 1
Dre-Mir-138-P1a dre-mir-138-2 MIR-138 GCUGGUG MIMAT0001835 MIMAT0048652 chr16 7836268 7836329 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-138-P2 dre-mir-138-1 MIR-138 GCUGGUG MIMAT0001835 MIMAT0031973 chr18 17580169 17580236 + Vertebrata Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-139 dre-mir-139 MIR-139 CUACAGU MIMAT0003349 MIMAT0032008 LKPD01049450.1 531 590 - Gnathostomata Gnathostomata No 1
Dre-Mir-140-P2 V dre-mir-140 MIR-140 CCACAGG MIMAT0001836 MIMAT0003159 chr25 34791384 34791445 + Gnathostomata Vertebrata 2 No 1
Dre-Mir-142-P2 V dre-mir-142a MIR-142 AUAAAGU MIMAT0001838 MIMAT0003160 chr5 3170753 3170812 + Gnathostomata Vertebrata 4 No 1
Dre-Mir-142-P4 V dre-mir-142b MIR-142 AUAAAGU MIMAT0001839 None chr15 15383910 15383969 - Gnathostomata Vertebrata 3 No 1
Dre-Mir-143 dre-mir-143 MIR-143 GAGAUGA None MIMAT0001840 chr14 38742335 38742389 + Vertebrata Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-144 V dre-mir-144 MIR-144 ACAGUAU MIMAT0031975 MIMAT0001841 chr5 42272092 42272150 - Vertebrata Vertebrata 2 No 1
Dre-Mir-145 dre-mir-145 MIR-145 UCCAGUU MIMAT0001842 MIMAT0031976 chr14 38743970 38744030 + Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-146-P1 dre-mir-146a MIR-146 GAGAACU MIMAT0001843 None chr13 11822194 11822254 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1 1
Dre-Mir-146-P4 V dre-mir-146b MIR-146 GAGAACU MIMAT0001844 None chr21 41639990 41640048 + Gnathostomata Vertebrata 2 No 1 1
Dre-Mir-148-P2 dre-mir-148 MIR-148 CAGUGCA None MIMAT0001845 chr9 1644693 1644750 - Gnathostomata Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-148-P3 dre-mir-152 MIR-148 CAGUGCA None MIMAT0001847 chr3 24095972 24096030 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-150 dre-mir-150 MIR-150 CUCCCAA MIMAT0001846 None chr3 32571319 32571379 + Gnathostomata Gnathostomata No 1
Dre-Mir-153-P1a dre-mir-153a MIR-153 UGCAUAG MIMAT0031978 MIMAT0001849 chr7 40485520 40485580 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-153-P2a dre-mir-153c MIR-153 UGCAUAG MIMAT0031979 MIMAT0001850 chr9 7612418 7612477 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-153-P2b dre-mir-153b MIR-153 UCAUUUU MIMAT0031977 MIMAT0001848 chr6 13980987 13981046 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-155 dre-mir-155 MIR-155 UAAUGCU MIMAT0001851 None chr1 576454 576513 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-181-P1a1 dre-mir-181a-1 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0001282 chr22 22826011 22826074 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-181-P1a2 dre-mir-181a-4 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0048653 chr21 8221816 8221875 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-181-P1b2 dre-mir-181a-2 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0032007 chr8 53023545 53023607 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-181-P1c1 dre-mir-181a-5 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0048655 chr2 45204644 45204703 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-181-P1c2 dre-mir-181a-3 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0048654 chr3 34197460 34197519 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-181-P2a1 dre-mir-181b-3 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001270 MIMAT0048656 chr22 22825805 22825864 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-181-P2a2 dre-mir-181d MIR-181 ACAUUCA MIMAT0048657 MIMAT0048658 chr21 8221672 8221730 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-181-P2b2 dre-mir-181b-2 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001270 MIMAT0031920 chr8 53023694 53023753 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-181-P2c1 dre-mir-181b-1 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001270 None chr2 45202237 45202295 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-181-P2c2 dre-mir-181c MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001852 MIMAT0031980 chr3 34197705 34197762 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-184-P1 dre-mir-184-1 MIR-184 GGACGGA None MIMAT0001853 chr18 26203314 26203376 - Clupeocephala Nephrozoa No 1
Dre-Mir-184-P2 dre-mir-184-2 MIR-184 GGACGGA None MIMAT0001853 chr7 30189601 30189663 - Clupeocephala Nephrozoa No 1
Dre-Mir-187 dre-mir-187 MIR-187 CGUGUCU None MIMAT0001274 chr19 34135627 34135688 + Osteichthyes Osteichthyes Yes 1
Dre-Mir-190-P1b dre-mir-190a MIR-190 GAUAUGU MIMAT0001854 None chr25 33139120 33139178 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-190-P3 dre-mir-190b MIR-190 GAUAUGU MIMAT0003747 None chr16 17705910 17705973 - Gnathostomata Bilateria No 1 1
Dre-Mir-191 dre-mir-462 MIR-191 AACGGAA MIMAT0001855 None chr8 26082318 26082381 + Gnathostomata Gnathostomata No
Dre-Mir-192-P4b dre-mir-192 MIR-192 UGACCUA MIMAT0001275 None chr10 27063369 27063431 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-193-P1a dre-mir-193b MIR-193 ACUGGCC MIMAT0031982 MIMAT0001857 chr3 43714712 43714771 + Vertebrata Bilateria No 1 1
Dre-Mir-193-P1b1 dre-mir-193a-1 MIR-193 ACUGGCC MIMAT0031981 MIMAT0001856 chr3 35959932 35959993 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P1b2 dre-mir-193a-2 MIR-193 ACUGGCC MIMAT0031981 MIMAT0001856 chr6 18517992 18518050 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P2a dre-mir-365-1 MIR-193 AAUGCCC None MIMAT0001875 chr3 43716841 43716901 + Vertebrata Bilateria Yes 1
Dre-Mir-193-P2b1 dre-mir-365-2 MIR-193 AAUGCCC None MIMAT0001875 chr3 35961005 35961067 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P2b2 dre-mir-365-3 MIR-193 AAUGCCC None MIMAT0001875 chr6 18516330 18516392 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-194-P4a dre-mir-194b MIR-194 GUAACAG MIMAT0001859 None LKPD01021295.1 6148 6206 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-194-P4b dre-mir-194a MIR-194 GUAACAG MIMAT0001858 None chr10 27063188 27063244 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-196-P1a dre-mir-196a-2 MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001276 MIMAT0031983 chr19 19747629 19747686 + Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-196-P1b dre-mir-196d MIR-196 AGGUAGU MIMAT0011313 None chr16 20913420 20913478 + Clupeocephala Olfactores No
Dre-Mir-196-P3a dre-mir-196b MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001860 None chr3 23673387 23673447 + Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-196-P4a dre-mir-196a-1 MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001276 None chr23 36088111 36088169 + Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-196-P4b dre-mir-196c MIR-196 AGGUAGU MIMAT0011298 None chr11 2190643 2190701 + Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-199-P1a V dre-mir-199-1 MIR-199 CAGUAGU MIMAT0001277 MIMAT0003155 chr20 14875474 14875534 + Clupeocephala Vertebrata 3 No 1
Dre-Mir-199-P2a V dre-mir-199-2 MIR-199 CAGUAGU MIMAT0001277 MIMAT0003155 chr5 1376779 1376839 - Clupeocephala Vertebrata 3 No
Dre-Mir-199-P2b V None MIR-199 CAGUAGU None None chr5 63709623 63709683 - Clupeocephala Vertebrata 3 No
Dre-Mir-199-P3 V dre-mir-199-3 MIR-199 CAGUAGU MIMAT0001277 MIMAT0031922 chr3 47195159 47195219 - Gnathostomata Vertebrata 3 No
Dre-Mir-202 dre-mir-202 MIR-202 UCCUAUG MIMAT0003406 MIMAT0001864 chr13 50602649 50602706 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-203-P1 V dre-mir-203b MIR-203 UGAAAUG MIMAT0003407 MIMAT0001865 chr20 27405891 27405949 + Clupeocephala Vertebrata 2 No
Dre-Mir-203-P2 V dre-mir-203a MIR-203 UGAAAUG MIMAT0031923 MIMAT0001278 chr17 45808184 45808243 + Clupeocephala Vertebrata 2 No
Dre-Mir-204-P1a dre-mir-204-3 MIR-204 UCCCUUU MIMAT0001279 MIMAT0048659 chr25 34590805 34590862 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-204-P1b dre-mir-204-2 MIR-204 UCCCUUU MIMAT0001279 MIMAT0031987 chr7 29337026 29337083 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-204-P2 dre-mir-204-1 MIR-204 UCCCUUU MIMAT0001279 MIMAT0031924 chr5 25972085 25972142 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-205-P4a dre-mir-205 MIR-205 CCUUCAU MIMAT0001280 MIMAT0031925 chr23 33290291 33290350 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-208-P1 dre-mir-736 MIR-208 UAAGACG None MIMAT0003767 chr2 24261228 24261283 - Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-210 dre-mir-210 MIR-210 UGUGCGU MIMAT0003392 MIMAT0001281 chr25 25506487 25506548 - Bilateria Bilateria No 1
Dre-Mir-214-P1 V dre-mir-214 MIR-214 CAGCAGG None MIMAT0001283 chr20 14877660 14877721 + Clupeocephala Gnathostomata 2 No
Dre-Mir-216-P2a dre-mir-216b MIR-216 AAUCUCU MIMAT0001867 None chr22 28780265 28780323 - Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-216-P2b dre-mir-216a MIR-216 AAUCUCA MIMAT0001284 None chr22 28779961 28780023 - Vertebrata Nephrozoa No
Dre-Mir-217 V dre-mir-217 MIR-217 ACUGCAU MIMAT0001285 None chr22 28779730 28779788 - Chordata Chordata 2 No 1
Dre-Mir-218-P2 dre-mir-218a-2 MIR-218 UGUGCUU MIMAT0001868 None chr1 23866891 23866954 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-218-P3 dre-mir-218b MIR-218 UGUGCUU MIMAT0001869 None chr10 17695275 17695332 + Gnathostomata Vertebrata Unknown 1
Dre-Mir-218-P4 V dre-mir-218a-1 MIR-218 UGUGCUU MIMAT0001868 None chr14 24562809 24562873 - Gnathostomata Vertebrata 2 No
Dre-Mir-219-P2a dre-mir-219-1 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0001286 None chr10 10329476 10329540 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-219-P2b dre-mir-219-2 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0001286 None chr5 65101371 65101437 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-219-P3a dre-mir-219-3 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0001286 MIMAT0031989 chr19 18861780 18861840 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-221-P1a1 dre-mir-222a MIR-221 GCUCAGU MIMAT0031927 MIMAT0001289 chr9 33921481 33921542 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-221-P1c dre-mir-222b MIR-221 GCUACAU None MIMAT0011303 chr21 44568190 44568252 - Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-221-P2a1 dre-mir-221 MIR-221 GCUACAU MIMAT0031926 MIMAT0001288 chr9 33920955 33921017 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-221-P2a2 None MIR-221 GCUACAU None None chr6 59901710 59901774 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-223 dre-mir-223 MIR-223 GUCAGUU None MIMAT0001290 chr5 22234413 22234477 - Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-338-P1 dre-mir-338-2 MIR-338 CCAGCAU None MIMAT0001873 chr12 17727559 17727620 + Vertebrata Vertebrata No 1 1 1
Dre-Mir-338-P2a dre-mir-338-3 MIR-338 CCAGCAU MIMAT0048672 MIMAT0048673 chr3 51907489 51907549 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-338-P2b dre-mir-338-1 MIR-338 CCAGCAU None MIMAT0001873 chr12 35710532 35710592 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-375-P1 dre-mir-375-1 MIR-375 UUGUUCG None MIMAT0001876 chr6 13800103 13800160 - Clupeocephala Nephrozoa No 1
Dre-Mir-375-P2 dre-mir-375-2 MIR-375 UUGUUCG None MIMAT0001876 chr9 11571983 11572043 - Clupeocephala Nephrozoa No 1
Dre-Mir-425 dre-mir-731 MIR-425 AUGACAC MIMAT0003761 None chr8 26082548 26082611 + Gnathostomata Gnathostomata No 1
Dre-Mir-430-o1a dre-mir-430a-1 MIR-430 AAGUGCU None MIMAT0001423 chr10 4493289 4493347 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b1 dre-mir-430a-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28694962 28695020 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b2 dre-mir-430a-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28696703 28696761 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b3 dre-mir-430a-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28699047 28699105 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b4 dre-mir-430a-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28700810 28700868 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b5 dre-mir-430a-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28708442 28708500 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b6 dre-mir-430a-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28706702 28706760 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b7 dre-mir-430a-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28704939 28704997 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b8 dre-mir-430a-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28703199 28703257 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1c dre-mir-430a-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031996 MIMAT0001423 chr4 28701436 28701494 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d1 dre-mir-430a-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031995 MIMAT0001423 chr4 28693846 28693904 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d2 dre-mir-430a-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031997 MIMAT0001423 chr4 28695588 28695646 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d3 dre-mir-430a-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031998 MIMAT0001423 chr4 28697329 28697387 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d4 dre-mir-430a-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031999 MIMAT0001423 chr4 28697933 28697991 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d5 dre-mir-430a-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032000 MIMAT0001423 chr4 28703825 28703883 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d6 dre-mir-430a-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032001 MIMAT0001423 chr4 28709068 28709126 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d7 dre-mir-430a-17 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032002 MIMAT0001423 chr4 28707328 28707386 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e1 dre-mir-430i-1 MIR-430 CCCUCAC MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28699673 28699731 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e2 dre-mir-430i-2 MIR-430 CCCUCAC MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28702062 28702120 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e3 dre-mir-430i-3 MIR-430 CCCUCAC MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28705565 28705623 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a1 dre-mir-430b-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28694231 28694289 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a2 dre-mir-430b-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28695382 28695440 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a3 dre-mir-430b-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28695972 28696030 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a4 dre-mir-430b-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28697727 28697785 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a5 dre-mir-430b-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28699467 28699525 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a6 dre-mir-430b-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28700079 28700137 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a7 dre-mir-430b-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28701856 28701914 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a8 dre-mir-430b-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28709466 28709524 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a9 dre-mir-430b-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28707712 28707770 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a10 dre-mir-430b-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28707122 28707180 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a11 dre-mir-430b-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28705971 28706029 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a12 dre-mir-430b-17 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28705359 28705417 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a13 dre-mir-430b-18 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28703619 28703677 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a14 dre-mir-430b-19 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28702468 28702526 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2b dre-mir-430b-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28693640 28693698 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c1 dre-mir-430b-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28697123 28697181 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c2 dre-mir-430b-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28701230 28701288 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c3 dre-mir-430b-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28708862 28708920 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2d1 dre-mir-430b-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28698317 28698375 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2d2 dre-mir-430b-20 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28704209 28704267 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o3a1 dre-mir-430c-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28693379 28693437 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a2 dre-mir-430c-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28693983 28694041 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a3 dre-mir-430c-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28695121 28695179 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a4 dre-mir-430c-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28695725 28695783 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a5 dre-mir-430c-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28696862 28696920 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a6 dre-mir-430c-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28697466 28697524 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a7 dre-mir-430c-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28699206 28699264 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a8 dre-mir-430c-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28709205 28709263 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a9 dre-mir-430c-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28708601 28708659 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a10 dre-mir-430c-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28707465 28707523 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a11 dre-mir-430c-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28706861 28706919 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a12 dre-mir-430c-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28705724 28705782 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a13 dre-mir-430c-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28702221 28702279 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a14 dre-mir-430c-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28701595 28701653 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a15 dre-mir-430c-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28700969 28701027 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a16 dre-mir-430c-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28699832 28699890 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3b1 None MIR-430 AAGUGCU None None chr4 28698070 28698128 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3b2 None MIR-430 AAGUGCU None None chr4 28703962 28704020 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-451 dre-mir-451 MIR-451 AACCGUU MIMAT0001634 chr5 42271979 42272020 - Vertebrata Vertebrata NA
Dre-Mir-455-P1 V dre-mir-455-1 MIR-455 AUGUGCC MIMAT0001879 MIMAT0031993 chr5 65250402 65250459 - Clupeocephala Vertebrata 3 No
Dre-Mir-455-P2 V dre-mir-455-2 MIR-455 AUGUGCC MIMAT0011302 MIMAT0031993 chr16 51776559 51776616 + Clupeocephala Vertebrata 3 No 1
Dre-Mir-456 dre-mir-456 MIR-456 AGGCUGG None MIMAT0001882 chr17 22827076 22827137 + Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-458 dre-mir-458 MIR-458 UAGCUCU MIMAT0032005 MIMAT0001885 chr14 25159138 25159195 - Osteichthyes Osteichthyes No 1
Dre-Mir-459 dre-mir-459 MIR-459 CAGUAAC MIMAT0001886 MIMAT0003408 chr1 1575493 1575555 + Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-460-P1 dre-mir-460 MIR-460 ACAGCGC MIMAT0001887 MIMAT0001888 chr2 2301366 2301424 - Osteichthyes Osteichthyes Yes 1 1
Dre-Mir-460-P2 dre-mir-730 MIR-460 CCUCAUU MIMAT0003760 None chr7 23362175 23362234 + Osteichthyes Osteichthyes Yes 1
Dre-Mir-489 V dre-mir-489 MIR-489 UGACAUC None MIMAT0002940 chr19 40781190 40781248 - Osteichthyes Osteichthyes 2 No 1
Dre-Mir-499-P1 dre-mir-499 MIR-499 UAAGACU MIMAT0003749 MIMAT0032009 chr11 25205169 25205227 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-499-P2 None MIR-499 UAAGACU None None chr23 18731335 18731394 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-551-P2 None MIR-551 CGACCCA None None chr15 35287289 35287345 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-722-P1 V None MIR-722 UUUGCAG None None chr3 49815209 49815273 - Clupeocephala Osteichthyes 2 No 1 1
Dre-Mir-722-P2 V dre-mir-722 MIR-722 UUUGCAG None MIMAT0003748 chr1 56363896 56363960 - Clupeocephala Osteichthyes 2 No 1 1
Dre-Mir-723-P2 dre-mir-723 MIR-723 GACAUCA MIMAT0003750 MIMAT0003751 chrUn_KN149706v1 28040 28100 - Clupeocephala Clupeocephala No 1
Dre-Mir-724-P1 V None MIR-724 UAAAGGG None None chr8 24064223 24064284 + Clupeocephala Neopterygii 2 No
Dre-Mir-724-P2 V dre-mir-724 MIR-724 UAAAGGG MIMAT0003752 None chr11 3176699 3176759 + Clupeocephala Neopterygii 2 No 1
Dre-Mir-725 dre-mir-725 MIR-725 UCAGUCA MIMAT0032010 MIMAT0003753 chr22 24366204 24366259 - Gnathostomata Gnathostomata No 1
Dre-Mir-726 dre-mir-726 MIR-726 UCACUAC None MIMAT0003754 chr11 25476111 25476171 - Osteichthyes Osteichthyes No 1
Dre-Mir-727-P1 V dre-mir-727 MIR-727 CAGUCUU MIMAT0003755 MIMAT0003756 chr24 26185423 26185489 + Clupeocephala Osteichthyes 2 No
Dre-Mir-728-P1 dre-mir-728 MIR-728 UACUAAG None MIMAT0003757 chr24 26190564 26190624 + Clupeocephala Neopterygii No 1
Dre-Mir-729 dre-mir-729 MIR-729 AUGGGUA None MIMAT0003758 chr4 13584505 13584565 + Neopterygii Neopterygii No
Dre-Mir-732 dre-mir-732 MIR-732 UCAAAGC None MIMAT0003762 chr9 41682940 41682998 + D. rerio D. rerio No
Dre-Mir-734 dre-mir-734 MIR-734 AAAUGCU None MIMAT0003765 chr1 34122894 34122960 + Neopterygii Neopterygii No 1 1
Dre-Mir-737 dre-mir-737 MIR-737 UUUUUUU MIMAT0032013 MIMAT0003768 chr18 45962916 45962976 + Osteichthyes Osteichthyes No 1 1
Dre-Mir-1306 dre-mir-1306 MIR-1306 CACCUCC MIMAT0028210 None chr5 24521686 24521746 + Gnathostomata Gnathostomata Yes 1 1
Dre-Mir-1388 dre-mir-1388 MIR-1388 UCUCAGG MIMAT0011292 MIMAT0011293 chr23 13604240 13604298 + Gnathostomata Gnathostomata No
Dre-Mir-1788 dre-mir-1788 MIR-1788 GCUUGUU MIMAT0011294 MIMAT0011295 chr9 11551626 11551682 - Vertebrata Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-2184-P1a dre-mir-2184 MIR-2184 ACAGUAA MIMAT0011288 None chr10 35654276 35654332 - D. rerio Gnathostomata No 1 1
Dre-Mir-2184-P1b None MIR-2184 ACAGUAA None None LKPD01047922.1 7188 7244 + D. rerio Gnathostomata No 1 1
Dre-Mir-2188 dre-mir-2188 MIR-2188 AGGUCCA MIMAT0011309 MIMAT0011310 chr5 69021881 69021940 - Gnathostomata Gnathostomata Yes 1 1
Dre-Mir-2189 dre-mir-2189 MIR-2189 GAUUGUU None MIMAT0011311 chrUn_KN150127v1 17180 17237 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-2191 dre-mir-2191 MIR-2191 CACACCU None MIMAT0011300 chr23 36790250 36790310 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-7132-P1 dre-mir-7132 MIR-7132 ACUUGGU MIMAT0048669 MIMAT0048670 chr3 59063772 59063829 + Clupeocephala Clupeocephala No 1 1
Dre-Mir-7133 dre-mir-7133 MIR-7133 AGUUUGA MIMAT0048664 MIMAT0048665 chr8 10020272 10020332 + Clupeocephala Clupeocephala No 1
Dre-Mir-7147 dre-mir-7147 MIR-7147 GUACCAU MIMAT0028205 None chr24 10948075 10948132 - Osteichthyes Osteichthyes No
Dre-Mir-7148 dre-mir-7148 MIR-7148 AUGGAAA MIMAT0028206 MIMAT0028207 chr2 57103411 57103473 - D. rerio D. rerio No
Dre-Mir-7149 dre-mir-7149 MIR-7149 UCCAAGU MIMAT0028208 MIMAT0028209 chr23 24074089 24074151 + D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-1 None DRE-NOVEL-1 AUUUUCU None None chr18 15584378 15584438 - D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-2 None DRE-NOVEL-2 UAUGUGU None None chr19 6275796 6275851 - D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-3 None DRE-NOVEL-3 CUGAUCA None None chr17 52860985 52861045 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-4 None DRE-NOVEL-4 CAGGAAU None None chr15 37725346 37725406 - D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-5 None DRE-NOVEL-5 CAUGUCA None None chr9 56359312 56359379 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Novel-6 None DRE-NOVEL-6 ACAAGGG None None chr3 26193747 26193808 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-7 None DRE-NOVEL-7 GGGCGAU None None chr22 364003 364066 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Novel-8 None DRE-NOVEL-8 AAAUAAU None None chr4 6920268 6920338 + D. rerio D. rerio No 1 1

(red - mature/co-mature, blue - star)

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all

Download genome coordinates (GFF format)

Download count matrix