| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-338-P1 | dre-mir-338-2 | MIR-338 | CCAGCAU | None | MIMAT0001873 | chr12 | 17727559 | 17727620 | + | Vertebrata | Vertebrata | No | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-338-P2a | dre-mir-338-3 | MIR-338 | CCAGCAU | MIMAT0048672 | MIMAT0048673 | chr3 | 51907489 | 51907549 | - | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-338-P2b | dre-mir-338-1 | MIR-338 | CCAGCAU | None | MIMAT0001873 | chr12 | 35710532 | 35710592 | - | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
