Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-27-P1 | dre-mir-27a | MIR-27 | UCACAGU | MIMAT0031949 | MIMAT0001796 | chr2 | 33902361 | 33902423 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-27-P2a | dre-mir-27d | MIR-27 | UCACAGU | None | MIMAT0001799 | chr10 | 15954740 | 15954804 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-27-P2b | dre-mir-27b | MIR-27 | UCACAGU | MIMAT0031950 | MIMAT0001797 | chr8 | 30167449 | 30167508 | - | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-27-P3 | dre-mir-27c | MIR-27 | UCACAGU | MIMAT0003401 | MIMAT0001798 | chr3 | 13406464 | 13406527 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-27-P4a | dre-mir-27e | MIR-27 | UCACAGU | None | MIMAT0001800 | chr22 | 5299972 | 5300035 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all