Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-24-P1 | dre-mir-24b | MIR-24 | GGCUCAG | MIMAT0048662 | MIMAT0048663 | chr2 | 33905775 | 33905834 | + | Gnathostomata | Vertebrata | Yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-24-P2a | dre-mir-24-1 | MIR-24 | GGCUCAG | None | MIMAT0001792 | chr10 | 15960847 | 15960904 | + | Clupeocephala | Vertebrata | Yes | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-24-P2b | dre-mir-24-3 | MIR-24 | GGCUCAG | None | MIMAT0001792 | chr8 | 30162533 | 30162590 | - | Clupeocephala | Vertebrata | Yes | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-24-P3 | dre-mir-24-2 | MIR-24 | GGCUCAG | None | MIMAT0001792 | chr3 | 13412992 | 13413050 | + | Gnathostomata | Vertebrata | Yes | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-24-P4a | dre-mir-24-4 | MIR-24 | GGCUCAG | None | MIMAT0001792 | chr22 | 5307502 | 5307561 | + | Clupeocephala | Vertebrata | Yes | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all