| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-23-P1 | dre-mir-23a-3 | MIR-23 | UCACAUU | MIMAT0031945 | MIMAT0001790 | chr2 | 33900445 | 33900503 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-23-P2a | dre-mir-23b | MIR-23 | UCACAUU | None | MIMAT0001791 | chr10 | 15954588 | 15954651 | + | Clupeocephala | Vertebrata | Yes | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-23-P2b | dre-mir-23b-2 | MIR-23 | UCACAUU | MIMAT0048660 | MIMAT0048661 | chr8 | 30167636 | 30167695 | - | Clupeocephala | Vertebrata | Yes | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-23-P3 | dre-mir-23a-2 | MIR-23 | UCACAUU | MIMAT0031944 | MIMAT0001790 | chr3 | 13406243 | 13406303 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-23-P4a | dre-mir-23a-1 | MIR-23 | UCACAUU | None | MIMAT0001790 | chr22 | 5293226 | 5293289 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
