MirGeneDB

127 microRNA genes with seed AUCACAG
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Dpu-Mir-2-o1 dpu-mir-2-1 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0012657 DAPPUscaffold_80 240864 240934 + D. pulex Protostomia No
Dpu-Mir-2-o2 dpu-mir-2-2 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0012657 DAPPUscaffold_80 241044 241106 + D. pulex Protostomia No 1
Dpu-Mir-2-o3 None MIR-2 AUCACAG None None DAPPUscaffold_80 240557 240644 + D. pulex Protostomia No
Dpu-Mir-2-o4 None MIR-2 AUCACAG None None DAPPUscaffold_32 69416 69503 - D. pulex Protostomia No
Dpu-Mir-2-o5 None MIR-2 AUCACAG None None DAPPUscaffold_77 78818 78876 - D. pulex Protostomia No 1
Dpu-Mir-2-o6 None MIR-2 AUCACAG None None DAPPUscaffold_80 240731 240792 + D. pulex Protostomia No
Isc-Mir-2-o7 isc-mir-2a MIR-2 AUCACAG None MIMAT0012696 DS799611 45175 45234 - Ixodes Protostomia No 1 1
Isc-Mir-2-o8 isc-mir-2b MIR-2 AUCACAG None MIMAT0012697 DS799611 45565 45627 - Ixodes Protostomia No 1
Cbr-Mir-2-o10 cbr-mir-2 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0029606 I 2714104 2714186 - Caenorhabditis Protostomia No
Cel-Mir-2-o10 cel-mir-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020302 MIMAT0000004 chrI 9372783 9372846 - Caenorhabditis Protostomia No
Cbr-Mir-2-o11 cbr-mir-43 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0000468 II 8891220 8891282 - Caenorhabditis Protostomia No
Cel-Mir-2-o11 cel-mir-43 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020308 MIMAT0000014 chrII 11889930 11889992 + Caenorhabditis Protostomia No
Lgi-Mir-2-o14 lgi-mir-2d MIR-2 AUCACAG None MIMAT0009559 LOTGIsca_2 4520084 4520140 + L. gigantea Protostomia No 1
Lgi-Mir-2-o26 lgi-mir-2c MIR-2 AUCACAG None MIMAT0009558 LOTGIsca_2 5780837 5780893 + L. gigantea Protostomia No 1
Lgi-Mir-2-o27a lgi-mir-2d MIR-2 AUCACAG None MIMAT0009559 LOTGIsca_2 4514963 4515021 - L. gigantea Protostomia No 1
Lgi-Mir-2-o27b lgi-mir-2d MIR-2 AUCACAG None MIMAT0009559 LOTGIsca_2 4515158 4515216 - L. gigantea Protostomia No
Cgi-Mir-2-o28 None MIR-2 AUCACAG None None scaffold1503 13873 13931 - C. gigas Protostomia No 1 1
Cgi-Mir-2-o29 None MIR-2 AUCACAG None None scaffold1503 15162 15221 - C. gigas Protostomia No 1
Cgi-Mir-2-o31 None MIR-2 AUCACAG None None scaffold602 445140 445196 + C. gigas Protostomia No 1
Cgi-Mir-2-o32 None MIR-2 AUCACAG None None scaffold602 445414 445474 + C. gigas Protostomia No 1
Cgi-Mir-2-o33 None MIR-2 AUCACAG None None scaffold602 445843 445901 + C. gigas Protostomia No
Cgi-Mir-2-o34 None MIR-2 AUCACAG None None scaffold602 446019 446076 + C. gigas Protostomia No 1
Cgi-Mir-2-o35 None MIR-2 AUCACAG None None scaffold602 446534 446592 + C. gigas Protostomia No 1 1
Cte-Mir-2-o36 cte-mir-2a MIR-2 AUCACAG None MIMAT0009503 CAPTEscaffold_933 10541 10616 + C. teleta Protostomia No 1
Cte-Mir-2-o38 cte-mir-2c MIR-2 AUCACAG None MIMAT0009505 CAPTEscaffold_933 10413 10471 + C. teleta Protostomia No 1
Cte-Mir-2-o39 cte-mir-2d-1 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0009678 CAPTEscaffold_36111 1054 1112 + C. teleta Protostomia No 1 1
Cte-Mir-2-o40 cte-mir-2e-1 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0013527 CAPTEscaffold_876 29359 29419 - C. teleta Protostomia No 1
Cte-Mir-2-o41 cte-mir-2f MIR-2 AUCACAG None MIMAT0013528 CAPTEscaffold_876 28955 29017 - C. teleta Protostomia No 1
Cte-Mir-2-o42 cte-mir-2g MIR-2 AUCACAG None MIMAT0013559 CAPTEscaffold_933 10173 10226 + C. teleta Protostomia No 1
Cte-Mir-2-o43 cte-mir-2709 MIR-2 AUCACAG MIMAT0013578 None CAPTEscaffold_876 29085 29145 - C. teleta Protostomia No 1
Efe-Mir-2-o44 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.126385 2777 2840 + E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-2-o45 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.128711 2118 2173 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-2-o46 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.155957 2068 2132 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-2-o47 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.155957 5781 5841 + E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-2-o48 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.1558418 151 207 - E. fetida Protostomia No
Efe-Mir-2-o49 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.159362 1072 1126 - E. fetida Protostomia No 1
Efe-Mir-2-o50 None MIR-2 AUCACAG None None Efet.01.159362 648 708 - E. fetida Protostomia No
Tca-Mir-2-o51-v1 tca-mir-2-1 MIR-2 AUCACAG MIMAT0019094 MIMAT0008353 LG3 561200 561258 + T. castaneum Protostomia No 1
Tca-Mir-2-o52-v1 tca-mir-2-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0019096 MIMAT0008353 LG3 561350 561410 + T. castaneum Protostomia No 1 1
Tca-Mir-2-o53-v2 tca-mir-2-3 MIR-2 AUCACAG MIMAT0019093 MIMAT0008353 LG3 560833 560889 + T. castaneum Protostomia No 1
Aae-Mir-2-o54 aae-mir-2a MIR-2 AUCACAG MIMAT0014225 MIMAT0014226 supercont1.268 888597 888663 - A. aegypti Protostomia No 1 1
Aae-Mir-2-o55-v1 aae-mir-2b MIR-2 AUCACAG None MIMAT0014306 supercont1.268 887257 887317 - A. aegypti Protostomia No
Aae-Mir-2-o56-v1 aae-mir-2c MIR-2 AUCACAG None MIMAT0014308 supercont1.268 889091 889155 - A. aegypti Protostomia No
Asu-Mir-2-o58a asu-mir-2a MIR-2 AUCACAG MIMAT0021425 MIMAT0021426 Scaffold65 285241 285298 + A. suum Protostomia No
Asu-Mir-2-o58b None MIR-2 AUCACAG None None Scaffold2380 4192 4249 + A. suum Protostomia No 1
Asu-Mir-2-o59 asu-mir-2b MIR-2 AUCACAG MIMAT0021427 MIMAT0021428 Scaffold287 267253 267310 - A. suum Protostomia No 1 1
Asu-Mir-2-o60 asu-mir-43d MIR-2 AUCACAG MIMAT0021433 MIMAT0021434 Scaffold187 163929 163989 - A. suum Protostomia No 1
Asu-Mir-2-o61 asu-mir-43a MIR-2 AUCACAG MIMAT0021449 MIMAT0021450 Scaffold800 98049 98111 - A. suum Protostomia No 1
Asu-Mir-2-o62a asu-mir-43b MIR-2 AUCACAG MIMAT0021451 MIMAT0021452 Scaffold1765 14467 14524 + A. suum Protostomia No
Asu-Mir-2-o62b asu-mir-43c-1 MIR-2 AUCACAG MIMAT0021453 MIMAT0021454 Scaffold919 52009 52066 + A. suum Protostomia No 1 1
Asu-Mir-2-o62c asu-mir-43c-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0022671 MIMAT0021454 Scaffold1171 26596 26653 + A. suum Protostomia No 1
Asu-Mir-2-o62d asu-mir-43e MIR-2 AUCACAG MIMAT0021435 MIMAT0021436 Scaffold1765 14913 14972 + A. suum Protostomia No 1
Hme-Mir-2-o63-v1 hme-mir-2a MIR-2 AUCACAG None MIMAT0024971 HE671256 344483 344538 + H. melpomene Protostomia No 1
Hme-Mir-2-o64-v1 hme-mir-2b MIR-2 AUCACAG None MIMAT0024972 HE671256 344898 344954 + H. melpomene Protostomia No 1
Hme-Mir-2-o65 hme-mir-2c MIR-2 AUCACAG None MIMAT0024973 HE671256 345032 345089 + H. melpomene Protostomia No 1
Dan-Mir-2-P1a-v1 dan-mir-2a-1 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008414 scaffold_12916 12013671 12013735 + Drosophila Protostomia No 1
Dme-Mir-2-P1a-v1 dme-mir-2a-1 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020780 MIMAT0000106 chr2L 19569901 19569966 - Drosophila Protostomia No 1
Dmo-Mir-2-P1a-v1 dmo-mir-2a-1 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008672 scaffold_6500 6908329 6908396 + Drosophila Protostomia No 1
Dan-Mir-2-P1b-v1 dan-mir-2a-2 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008414 scaffold_12916 12013993 12014052 + Drosophila Protostomia No
Dme-Mir-2-P1b-v1 dme-mir-2a-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020781 MIMAT0000106 chr2L 19569495 19569554 - Drosophila Protostomia No
Dmo-Mir-2-P1b-v1 dmo-mir-2a-2 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008672 scaffold_6500 6908918 6908977 + Drosophila Protostomia No
Bge-Mir-2-o66-v1 None MIR-2 AUCACAG None None KZ615436.1 350982 351043 - B. germanica Protostomia No 1
Dme-Mir-2-P2a dme-mir-2b-1 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020782 MIMAT0000107 chr2L 8258623 8258684 - D. melanogaster Protostomia No
Dan-Mir-2-P2a-v1 None MIR-2 AUCACAG None None scaffold_12916 6006068 6006130 + Drosophila Protostomia No 1
Dan-Mir-2-P2b dan-mir-2b MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008417 scaffold_12916 12013322 12013390 + Drosophila Protostomia Yes
Dme-Mir-2-P2b dme-mir-2b-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020783 MIMAT0000107 chr2L 19570189 19570256 - D. melanogaster Protostomia No
Dmo-Mir-2-P2b dmo-mir-2b MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008650 scaffold_6500 6907827 6907894 + Drosophila Protostomia Yes
Bge-Mir-2-o67-v1 None MIR-2 AUCACAG None None KZ615436.1 353745 353804 - B. germanica Protostomia No 1 1
Dan-Mir-2-P3-v2 dan-mir-2c MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008442 scaffold_13340 12827849 12827913 - Drosophila Protostomia No
Dme-Mir-2-P3-v2 dme-mir-2c MIR-2 AUCACAG MIMAT0020845 MIMAT0000411 chr3R 15417760 15417826 - Drosophila Protostomia No
Aae-Mir-2-P4 aae-mir-13 MIR-2 AUCACAG MIMAT0014255 MIMAT0014256 supercont1.268 888744 888807 - Endopterygota Protostomia No
Bge-Mir-2-o68-v1 None MIR-2 AUCACAG None None KZ615136.1 496135 496195 + B. germanica Protostomia No 1
Dan-Mir-2-P4a dan-mir-13a MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008420 scaffold_13340 12827632 12827693 - Drosophila Protostomia No
Dme-Mir-2-P4a dme-mir-13a MIR-2 AUCACAG MIMAT0020795 MIMAT0000118 chr3R 15417547 15417609 - Drosophila Protostomia No 1
Dmo-Mir-2-P4a dmo-mir-13a MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008661 scaffold_6540 10568361 10568422 + Drosophila Protostomia No 1
Dan-Mir-2-P4b1 dan-mir-13b-1 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008426 scaffold_13340 12827487 12827547 - Drosophila Protostomia No 1
Dme-Mir-2-P4b1 dme-mir-13b-1 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020796 MIMAT0000119 chr3R 15417411 15417470 - Drosophila Protostomia No 1
Dmo-Mir-2-P4b1 dmo-mir-13b-1 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008636 scaffold_6540 10568529 10568588 + Drosophila Protostomia No 1
Dan-Mir-2-P4b2 dan-mir-13b-2 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008426 scaffold_13047 797494 797554 + Drosophila Protostomia No 1
Dme-Mir-2-P4b2 dme-mir-13b-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020797 MIMAT0000119 chrX 9091237 9091297 + Drosophila Protostomia No 1 1
Dmo-Mir-2-P4b2 dmo-mir-13b-2 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008636 scaffold_6473 13342567 13342628 - Drosophila Protostomia No 1 1
Tca-Mir-2-P4c tca-mir-13a MIR-2 AUCACAG MIMAT0019103 MIMAT0008359 LG3 560954 561011 + T. castaneum Protostomia No 1 1
Tca-Mir-2-P4d tca-mir-13b MIR-2 AUCACAG MIMAT0019104 MIMAT0008360 LG3 561066 561124 + T. castaneum Protostomia No 1
Hme-Mir-2-P4e hme-mir-13a MIR-2 AUCACAG None MIMAT0024940 HE671256 344637 344695 + Endopterygota Protostomia No
Hme-Mir-2-P4f hme-mir-13b MIR-2 AUCACAG None MIMAT0024941 HE671256 344775 344830 + Endopterygota Protostomia No
Bge-Mir-2-o69 None MIR-2 AGUCAAA None None KZ615436.1 353858 353916 - B. germanica Protostomia No 1
Bge-Mir-2-o70 None MIR-2 AUCACAG None None KZ615136.1 496273 496334 + B. germanica Protostomia No 1
Dan-Mir-2-P6a dan-mir-6-1 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008462 scaffold_13266 9731826 9731883 + Drosophila Protostomia No 1
Dme-Mir-2-P6a dme-mir-6-1 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020787 MIMAT0000111 chr2R 19661012 19661074 - Drosophila Protostomia No 1
Dan-Mir-2-P6b dan-mir-6-2 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008462 scaffold_13266 9731970 9732041 + Drosophila Protostomia No 1
Dme-Mir-2-P6b dme-mir-6-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020788 MIMAT0000111 chr2R 19660874 19660935 - Drosophila Protostomia No 1
Dmo-Mir-2-P6b dmo-mir-6-2 MIR-2 GGGAACU None MIMAT0008635 scaffold_6496 20936142 20936210 - Drosophila Protostomia No
Dan-Mir-2-P6c dan-mir-6-3 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008462 scaffold_13266 9732130 9732191 + Drosophila Protostomia No 1
Dme-Mir-2-P6c dme-mir-6-3 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020789 MIMAT0000111 chr2R 19660722 19660787 - Drosophila Protostomia No 1
Aae-Mir-2-P7 aae-mir-11 MIR-2 AUCACAG MIMAT0014241 MIMAT0014242 supercont1.744 322020 322083 + Neoptera Protostomia No 1
Bge-Mir-2-P7 None MIR-2 AUCACAG None None KZ614377.1 360106 360165 + Neoptera Protostomia No 1 1
Dan-Mir-2-P7 dan-mir-11 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008472 scaffold_13340 5675694 5675758 + Neoptera Protostomia No 1
Dme-Mir-2-P7 dme-mir-11 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020793 MIMAT0000116 chr3R 21622503 21622563 - Neoptera Protostomia No 1
Dmo-Mir-2-P7 dmo-mir-11 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008679 scaffold_6540 1740130 1740196 - Neoptera Protostomia No 1 1
Hme-Mir-2-P7 hme-mir-11 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0024934 HE672080 326757 326812 - Neoptera Protostomia No 1
Lan-Mir-2-o71 None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01000138 116653 116710 - L. anatina Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P7 tca-mir-11 MIR-2 AUCACAG MIMAT0018854 MIMAT0018855 LG5 7197519 7197576 + Neoptera Protostomia No 1 1
Dme-Mir-2-P8 dme-mir-308 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020833 MIMAT0000399 chr2R 14215802 14215862 - Endopterygota Protostomia No 1
Hme-Mir-2-P8 hme-mir-308 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0024977 HE669504 9991 10044 + Endopterygota Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P8 tca-mir-308 MIR-2 AUCACAG MIMAT0018706 MIMAT0018707 LG2 4737006 4737062 - Endopterygota Protostomia No 1 1
Lan-Mir-2-o72a None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01002046 29414 29471 + L. anatina Protostomia No 1
Lan-Mir-2-o72b None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01000138 117326 117383 - L. anatina Protostomia No 1
Lan-Mir-2-o73 None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01000222 414455 414514 + L. anatina Protostomia No 1 1
Lan-Mir-2-o74 None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01000397 182869 182928 + L. anatina Protostomia No 1
Aae-Mir-2-P10a aae-mir-2944b MIR-2 AAGGAAC MIMAT0014304 MIMAT0015373 supercont1.602 93656 93722 + A. aegypti Protostomia No
Tca-Mir-2-P10a tca-mir-2944a MIR-2 AUCACAG MIMAT0018718 MIMAT0018719 LG3 15689938 15689994 + T. castaneum Protostomia No 1
Aae-Mir-2-P10b aae-mir-2944b MIR-2 AAGGAAC MIMAT0014304 MIMAT0015373 supercont1.150 907506 907572 + A. aegypti Protostomia No
Tca-Mir-2-P10b tca-mir-2944b MIR-2 AAGGAAC MIMAT0018746 MIMAT0018747 LG5 7455840 7455901 + T. castaneum Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P10c tca-mir-2944c MIR-2 AUCACAG MIMAT0018810 MIMAT0018811 LG9 10977 11036 - T. castaneum Protostomia No 1
Asu-Mir-2-P11 asu-mir-250 MIR-2 AUCACAG MIMAT0021507 MIMAT0021508 Scaffold287 267429 267487 - Chromadorea Protostomia No 1
Cbr-Mir-2-P11 cbr-mir-250 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0000505 V 9339455 9339515 - Chromadorea Protostomia No
Cel-Mir-2-P11 cel-mir-250 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020339 MIMAT0000306 chrV 11769936 11769998 - Chromadorea Protostomia No
Lan-Mir-2-o75 None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01000806 162292 162350 + L. anatina Protostomia No
Lan-Mir-2-o76 None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01000806 164274 164333 + L. anatina Protostomia No 1
Lan-Mir-2-o77a None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01002046 29074 29133 + L. anatina Protostomia No 1 1
Lan-Mir-2-o77b None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01000138 117664 117723 - L. anatina Protostomia No 1 1
Lan-Mir-2-o78 None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01002046 30083 30141 + L. anatina Protostomia No 1
Lan-Mir-2-o79 None MIR-2 AUCACAG None None LFEI01000806 164633 164697 + L. anatina Protostomia No
Cbr-Mir-2222-P2a None MIR-2222 AUCACAG None None X 20535658 20535719 + C. briggsae C. briggsae No 1
Cbr-Mir-2222-P2b None MIR-2222 AUCACAG None None X 20537329 20537390 - C. briggsae C. briggsae No 1
Mdo-Novel-2 None MAR-NOVEL-2 AUCACAG None None 6 166795585 166795641 + Marsupialia Marsupialia No 1
Sha-Novel-2 None MAR-NOVEL-2 AUCACAG None None GL841562.1 1562608 1562664 + Marsupialia Marsupialia No 1

Get sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all