| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-2-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dlo-Mir-2-P2a Dlo-Mir-2-P2b Dlo-Mir-2-P3-v1 Dlo-Mir-2-P5 Dlo-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-2-P1-v1 Aga-Mir-2-P1-v1 Bge-Mir-2-P1-v1 Csc-Mir-2-P1n Csc-Mir-2-P1o Dan-Mir-2-P1-v1 Dma-Mir-2-P1 Dme-Mir-2-P1-v1 Dmo-Mir-2-P1 Dpu-Mir-2-P1 Dsi-Mir-2-P1-v1 Dya-Mir-2-P1-v1 Gpa-Mir-2-P1-v1 Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P1-v1 Isc-Mir-2-P1 Lpo-Mir-2-P1g Lpo-Mir-2-P1h Lpo-Mir-2-P1i Lpo-Mir-2-P1j Lpo-Mir-2-P1k Lpo-Mir-2-P1l Lpo-Mir-2-P1m Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P1-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087235.1: 3199844-3199898 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P1-v1) |
Mir-71
NC_087235.1: 3199632-3199694 [+]
Ensembl
Mir-2-P1-v1 NC_087235.1: 3199844-3199898 [+] Ensembl Mir-2-P1-v2 NC_087235.1: 3199844-3199898 [+] Ensembl Mir-2-P2a NC_087235.1: 3200022-3200076 [+] Ensembl Mir-2-P2b NC_087235.1: 3200200-3200258 [+] Ensembl Mir-2-P3-v1 NC_087235.1: 3200363-3200424 [+] Ensembl Mir-2-P3-v2 NC_087235.1: 3200363-3200424 [+] Ensembl Mir-67-P15-v1 NC_087235.1: 3201487-3201550 [+] Ensembl Mir-67-P15-v2 NC_087235.1: 3201488-3201549 [+] Ensembl |
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| Variant | Dlo-Mir-2-P1-v1 |
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| Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGGAUGUUGCAGGCGAGGACAUGCUUUUACCAUCAAAGCUGGUUUGUUAUAGAUUUUCGACUAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGCAAAAUUGUGUCCAAUGUCAACCAGGGUGUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUGGAUGUUGCAGGCGA- GC AC-| U U AUU GGACAU UUUU CAUCAAAGCUGGUU GU AUAG U CCUGUG AAAA GUAGUUUCGACCGA CA UAUC U GUGUGGGACCAACUGUAA UU CGA^ - C AGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dlo-Mir-2-P1-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAUCAAAGCUGGUUUGUUAUAGA -24
Get sequence
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| Mature sequence | Dlo-Mir-2-P1-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
32- UAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGC -55
Get sequence
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| Variant | Dlo-Mir-2-P1-v2 |
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| Seed | CACAGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGGAUGUUGCAGGCGAGGACAUGCUUUUACCAUCAAAGCUGGUUUGUUAUAGAUUUUCGACUAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGCAAAAUUGUGUCCAAUGUCAACCAGGGUGUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUGGAUGUUGCAGGCGA- GC AC-| U U GAUU GGACAU UUUU CAUCAAAGCUGGUU GU AUA U CCUGUG AAAA GUAGUUUCGACCGA CA UAU U GUGUGGGACCAACUGUAA UU CGA^ - C CAGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dlo-Mir-2-P1-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAUCAAAGCUGGUUUGUUAUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dlo-Mir-2-P1-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- UCACAGCCAGCUUUGAUGAGC -55
Get sequence
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