| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-67-P15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dlo-Mir-67-P14-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dpu-Mir-67 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pdu-Mir-67 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tur-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. longicaudata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087235.1: 3201487-3201550 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-P15-v1) |
Mir-71
NC_087235.1: 3199632-3199694 [+]
Ensembl
Mir-2-P1-v1 NC_087235.1: 3199844-3199898 [+] Ensembl Mir-2-P1-v2 NC_087235.1: 3199844-3199898 [+] Ensembl Mir-2-P2a NC_087235.1: 3200022-3200076 [+] Ensembl Mir-2-P2b NC_087235.1: 3200200-3200258 [+] Ensembl Mir-2-P3-v1 NC_087235.1: 3200363-3200424 [+] Ensembl Mir-2-P3-v2 NC_087235.1: 3200363-3200424 [+] Ensembl Mir-67-P15-v1 NC_087235.1: 3201487-3201550 [+] Ensembl Mir-67-P15-v2 NC_087235.1: 3201488-3201549 [+] Ensembl |
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| Variant | Dlo-Mir-67-P15-v1 |
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| Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUCAGAACAUCGACAUAUCGACUGCUUUGCCCGUCAGAGUGGUUGUGAUGUGGGGAUUUUGUGAAUGCAUAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGCGAUACAGUACGAUCAAUCUCAUCUGCAGUCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUUCAGAACAUCGACAU- - CU C -| GGGAUUU AUCG ACUG UUGC CGUCAGAG UGGUUGUGAUGUG \ UAGC UGAC AGCG GUAGUUUC ACCGACACUAUAC U CCUGACGUCUACUCUAAC A AU A G^ GUAAGUG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dlo-Mir-67-P15-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCCGUCAGAGUGGUUGUGAUGUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dlo-Mir-67-P15-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGCG -64
Get sequence
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| Variant | Dlo-Mir-67-P15-v2 |
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| Seed | CACAGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCAGAACAUCGACAUAUCGACUGCUUUGCCCGUCAGAGUGGUUGUGAUGUGGGGAUUUUGUGAAUGCAUAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGCGAUACAGUACGAUCAAUCUCAUCUGCAGUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUCAGAACAUCGACAUA- - CU C -| UGGGGAUUU UCG ACUG UUGC CGUCAGAG UGGUUGUGAUG \ AGC UGAC AGCG GUAGUUUC ACCGACACUAU U CUGACGUCUACUCUAACU A AU A G^ ACGUAAGUG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dlo-Mir-67-P15-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCGUCAGAGUGGUUGUGAUG -20
Get sequence
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| Mature sequence | Dlo-Mir-67-P15-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UCACAGCCAGCUUUGAUGAGC -62
Get sequence
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