| MirGeneDB ID | Pca-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Penis worm (Priapulus caudatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-67-v1 Aga-Mir-67-v1 Agr-Mir-67-v1 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Csc-Mir-67-P12 Csc-Mir-67-P13 Cte-Mir-67 Dan-Mir-67-v1 Dgr-Mir-67 Dlo-Mir-67-P14-v1 Dlo-Mir-67-P15-v1 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v1 Dmo-Mir-67-v1 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v1 Dya-Mir-67-v1 Eba-Mir-67-v1 Efe-Mir-67-P1 Efe-Mir-67-P2 Efe-Mir-67-P3 Egr-Mir-67 Gpa-Mir-67-P12-v1 Gpa-Mir-67-P13-v1 Gsa-Mir-67 Hme-Mir-67-v1 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Lpo-Mir-67-P7 Lpo-Mir-67-P8 Lpo-Mir-67-P9 Lpo-Mir-67-P10 Lpo-Mir-67-P11 Mgi-Mir-67-P4 Mgi-Mir-67-P5 Mgi-Mir-67-P6 Mom-Mir-67-v1 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pcr-Mir-67-v1 Pdu-Mir-67 Pve-Mir-67-v1 Rph-Mir-67-v1 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tca-Mir-67-v1 Tur-Mir-67 War-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Priapulus_caudatus_gca000485595v2) |
KQ715186.1: 93487-93547 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67) |
Novel-3-P2
KQ715186.1: 93118-93177 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-67 KQ715186.1: 93487-93547 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGCUCACACGAUAUAUCCGUUGCGACGUCCACUUUCUCGGGAAGGUUGUAGUGAAUGAUUUACAAGCAUCACAACCACCCAAGAGGAAGUGGUCGUCGGCGGUCACUCUACAAUGCAAGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGCUCACACGAUAUAUC---| UG U -- AA A AAUGAU CGU CGACG CCACUUUCUC GGG GGUUGU GUG \ GCG GCUGC GGUGAAGGAG CCC CCAACA UAC U ACGAACGUAACAUCUCACUG^ -- U AA A- C GAACAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pca-Mir-67_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUUUCUCGGGAAGGUUGUAGUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Pca-Mir-67_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UCACAACCACCCAAGAGGAAGUG -61
Get sequence
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