MirGeneDB ID | Dmo-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila mojavensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dmo-mir-307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-67-v1 Aga-Mir-67-v1 Agr-Mir-67-v1 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dan-Mir-67-v1 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v1 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v1 Dya-Mir-67-v1 Eba-Mir-67-v1 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hme-Mir-67-v1 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Mom-Mir-67-v1 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pcr-Mir-67-v1 Pdu-Mir-67 Pve-Mir-67-v1 Rph-Mir-67-v1 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tca-Mir-67-v1 Tur-Mir-67 War-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Dmoj_caf1) |
scaffold_6496: 24271692-24271757 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v1) |
Mir-67-v1
scaffold_6496: 24271692-24271757 [+]
Ensembl
Mir-67-v2 scaffold_6496: 24271692-24271757 [+] Ensembl |
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Variant | Dmo-Mir-67-v1 |
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Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGAAAACUAAGAAUUUUGUCUUGCUUUGACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUUAUUUCGAUUCGGUAUCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGAUAGCAGGAUAGAAUAUCCACAAAGCUAAACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAGAAAACUAAGAAUU-- -| A CCU G UUAUUUCG UUGUCUUGCU UUG CUCACUCAA GG UGUGAUG A GAUAGGACGA AGC GAGUGAGUU CC ACACUAC U CAAAUCGAAACACCUAUAA U^ - CCU A CUAUGGCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dmo-Mir-67-v1_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAUG -23
Get sequence
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Mature sequence | Dmo-Mir-67-v1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0008665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- UCACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -66
Get sequence
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Variant | Dmo-Mir-67-v2 |
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Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGAAAACUAAGAAUUUUGUCUUGCUUUGACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUUAUUUCGAUUCGGUAUCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGAUAGCAGGAUAGAAUAUCCACAAAGCUAAACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAGAAAACUAAGAAUU-- -| A CCU G GUUAUUUCG UUGUCUUGCU UUG CUCACUCAA GG UGUGAU A GAUAGGACGA AGC GAGUGAGUU CC ACACUA U CAAAUCGAAACACCUAUAA U^ - CCU A CCUAUGGCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dmo-Mir-67-v2_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAU -22
Get sequence
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Mature sequence | Dmo-Mir-67-v2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0008665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
44- CACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -66
Get sequence
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