| MirGeneDB ID | War-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Wirenia (Solenogaster) (Wirenia argentea) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-67-v1 Aga-Mir-67-v1 Agr-Mir-67-v1 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dan-Mir-67-v1 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v1 Dmo-Mir-67-v1 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v1 Dya-Mir-67-v1 Eba-Mir-67-v1 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hme-Mir-67-v1 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Mom-Mir-67-v1 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pcr-Mir-67-v1 Pdu-Mir-67 Pve-Mir-67-v1 Rph-Mir-67-v1 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tca-Mir-67-v1 Tur-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_025802215.1_ASM2580221v1_Wirenia) |
WNLI01147442.1: 1826-1883 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v1) |
Mir-67-v1
WNLI01147442.1: 1826-1883 [-]
Ensembl
Mir-67-v2 WNLI01147442.1: 1826-1883 [-] Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant | War-Mir-67-v1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAUGGCGGCCAUUUUGUCACAUGUGAUCCCUUGUUCAGCCUGGUUGUGAUGUGACAAAGACGUCAUCACAACCUGCUUGAAUGAGGAACCACGAGUGGCGCUUUCUGCAAAAUGACGGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CCAUGGCGGCCAUUUUG-- A AUC UG -| CU UGACA UCAC UGUG CCU UUC AGC GGUUGUGAUG A GGUG GCAC GGA AAG UCG CCAACACUAC A GCAGUAAAACGUCUUUCGC A CAA GU U^ U- UGCAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | War-Mir-67-v1_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUGUUCAGCCUGGUUGUGAUG -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | War-Mir-67-v1_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UCACAACCUGCUUGAAUGAGGA -58
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant | War-Mir-67-v2 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAUGGCGGCCAUUUUGUCACAUGUGAUCCCUUGUUCAGCCUGGUUGUGAUGUGACAAAGACGUCAUCACAACCUGCUUGAAUGAGGAACCACGAGUGGCGCUUUCUGCAAAAUGACGGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CCAUGGCGGCCAUUUUG-- A AUC UG -| CU GUGACA UCAC UGUG CCU UUC AGC GGUUGUGAU A GGUG GCAC GGA AAG UCG CCAACACUA A GCAGUAAAACGUCUUUCGC A CAA GU U^ U- CUGCAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | War-Mir-67-v2_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUGUUCAGCCUGGUUGUGAU -21
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | War-Mir-67-v2_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACAACCUGCUUGAAUGAGGA -58
Get sequence
|
