MirGeneDB ID | Cel-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-67-v1 Aae-Mir-67-v2 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cgi-Mir-67-P4 Cgi-Mir-67-P5 Cgi-Mir-67-P6 Csc-Mir-67 Cte-Mir-67 Dan-Mir-67-v1 Dan-Mir-67-v2 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v1 Dme-Mir-67-v2 Dme-Mir-67-v3 Dmo-Mir-67-v1 Dmo-Mir-67-v2 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v1 Dsi-Mir-67-v2 Dsi-Mir-67-v3 Dya-Mir-67-v1 Dya-Mir-67-v2 Dya-Mir-67-v3 Efe-Mir-67-P1 Efe-Mir-67-P2 Efe-Mir-67-P3 Hme-Mir-67-v1 Hme-Mir-67-v2 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Lpo-Mir-67-P7 Lpo-Mir-67-P8 Lpo-Mir-67-P9 Lpo-Mir-67-P10 Lpo-Mir-67-P11 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ovu-Mir-67 Sme-Mir-67 Tca-Mir-67-v1 Tca-Mir-67-v2 Tca-Mir-67-v3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrIII: 5931364-5931428 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAUUCCAACUCGAUCAAAGAUUCGUCGAUCCGCUCAUUCUGCCGGUUGUUAUGCUAUUAUCAGAUUAAGCAUCACAACCUCCUAGAAAGAGUAGAUCGAUUUUAAAACUUUGAAUUUCGUUUAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UAUUCCAACUCGAUCAAAGAUUC-- CG A CC-| U CUAUUAU GUCGAUC CUC UUCUG GGUUGU AUG C UAGCUAG GAG AAGAU CCAACA UAC A UUAUUUGCUUUAAGUUUCAAAAUUU AU A CCU^ C GAAUUAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cel-Mir-67_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGCUCAUUCUGCCGGUUGUUAUG -23
Get sequence
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Mature sequence | Cel-Mir-67_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- UCACAACCUCCUAGAAAGAGUAGA -65
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000039 TargetScanWorm: cel-miR-67 |