| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-2-P3b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-2b-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dsi-Mir-2-P1-v1 Dsi-Mir-2-P1-v2 Dsi-Mir-2-P2a Dsi-Mir-2-P2b1 Dsi-Mir-2-P2b2 Dsi-Mir-2-P3a Dsi-Mir-2-P4a-v1 Dsi-Mir-2-P4a-v2 Dsi-Mir-2-P4b-v1 Dsi-Mir-2-P4b-v2 Dsi-Mir-2-P5 Dsi-Mir-2-P6a Dsi-Mir-2-P6b Dsi-Mir-2-P6c Dsi-Mir-2-P7 Dsi-Mir-2-P8 Dsi-Mir-2-P9-v1 Dsi-Mir-2-P9-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-2-P3 Bge-Mir-2-P3 Cbr-Mir-2-o3 Cel-Mir-2-o3 Dan-Mir-2-P3b Dma-Mir-2-P3 Dme-Mir-2-P3b Dmo-Mir-2-P3b Dpu-Mir-2-P3 Dya-Mir-2-P3b Hme-Mir-2-P3-v1 Hme-Mir-2-P3-v2 Isc-Mir-2-P3 Tca-Mir-2-P3-v1 Tca-Mir-2-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2L: 19065872-19065940 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P3b) |
Mir-2-P4b-v1
2L: 19065170-19065229 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2-P4b-v2 2L: 19065170-19065229 [-] UCSC Ensembl Mir-2-P4a-v1 2L: 19065589-19065654 [-] UCSC Ensembl Mir-2-P4a-v2 2L: 19065589-19065654 [-] UCSC Ensembl Mir-2-P3b 2L: 19065872-19065940 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCGUCGAAUCGAAACAGGAGAAUUGUGUCAUUCUUCAAAGUGGUUGUGAAAUGUUUGCCUUUUUAUGCCUAUUCAUAUCACAGCCAGCUUUGAGGAGCGACGCGAUGCUCAAGGCAAAAAAAAAAAAAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UCGUCGAAUCGAAACAG-- A A -| A UUUGCCUUU GAG AUUGUGUC UUCUUCAAAG UGGUUGUGA AUG U CUC UAGCGCAG GAGGAGUUUC ACCGACACU UAC U UAAAAAAAAAAAAACGGAA G C G^ A UUAUCCGUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-2-P3b_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCUUCAAAGUGGUUGUGAAAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-2-P3b_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
45- UAUCACAGCCAGCUUUGAGGAGCG -69
Get sequence
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