MirGeneDB ID | Dsi-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dsi-Mir-2-P1-v1 Dsi-Mir-2-P2a Dsi-Mir-2-P2b1 Dsi-Mir-2-P2b2 Dsi-Mir-2-P3a Dsi-Mir-2-P3b Dsi-Mir-2-P4a-v1 Dsi-Mir-2-P4b-v1 Dsi-Mir-2-P5 Dsi-Mir-2-P6a Dsi-Mir-2-P6b Dsi-Mir-2-P6c Dsi-Mir-2-P8 Dsi-Mir-2-P9-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-2-P7 Aga-Mir-2-P7 Asu-Mir-2-o7a Asu-Mir-2-o7b Bge-Mir-2-P7 Dan-Mir-2-P7 Dlo-Mir-2-P7 Dme-Mir-2-P7 Dmo-Mir-2-P7 Dya-Mir-2-P7 Gpa-Mir-2-P7 Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P7 Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
3R: 3864432-3864492 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P7) |
Mir-2-P7
3R: 3864432-3864492 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-29-P2h 3R: 3864973-3865069 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCAUUUAGAUCUCCAUGAGGCGCACUUGUCAAGAACUUUCUCUGUGACCCGCGUGUACUUAAAAGCCGCAUCACAGUCUGAGUUCUUGCUGAGUGCGAAAUCCUCGAAGCAACAUUAAGCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UGCAUUUAGAUCUCCAU- GG-| U UCU CC CGUGUAC GA CGCACUUG CAAGAACUU CUGUGA CG \ CU GCGUGAGU GUUCUUGAG GACACU GC U CGAAUUACAACGAAGCUC AAA^ C UCU AC CGAAAAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dsi-Mir-2-P7_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAAGAACUUUCUCUGUGACCCG -22
Get sequence
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Mature sequence | Dsi-Mir-2-P7_3p |
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mirBase accession | MIMAT0008865 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CAUCACAGUCUGAGUUCUUGCU -61
Get sequence
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