MirGeneDB ID | Bge-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cockroach (Blattella germanica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bge-Mir-2-P1-v1 Bge-Mir-2-P2a Bge-Mir-2-P2b Bge-Mir-2-P3-v1 Bge-Mir-2-P4-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-2-P7 Aga-Mir-2-P7 Asu-Mir-2-o7a Asu-Mir-2-o7b Dan-Mir-2-P7 Dlo-Mir-2-P7 Dme-Mir-2-P7 Dmo-Mir-2-P7 Dsi-Mir-2-P7 Dya-Mir-2-P7 Gpa-Mir-2-P7 Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P7 Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Bger_2.0) |
KZ614377.1: 360106-360165 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P7) |
Mir-2-P7
KZ614377.1: 360106-360165 [+]
Ensembl
Mir-29-P2h KZ614377.1: 366509-366566 [+] Ensembl |
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Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUGCUUUUAAUGAGUGUGGUGCUUUGGUGCCAGAACUCUGGCUGUGACAUUGUGCAGUAUAUAGGUCACAUCACAGACAGAGUUCUAGUUACCCGUGCAUCCUGUGCUGCACAACUAACAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GUGCUUUUAAUGAGUGU-- UUU -| C G CAU CAGUA GGUGC GGU GC AGAACUCUG CUGUGA UGUG U CUACG CCA UG UCUUGAGAC GACACU ACAC A ACAAUCAACACGUCGUGUC UGC U^ A A --- UGGAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Bge-Mir-2-P7_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAGAACUCUGGCUGUGACAUUGUG -24
Get sequence
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Mature sequence | Bge-Mir-2-P7_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- CAUCACAGACAGAGUUCUAGUU -60
Get sequence
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