MirGeneDB ID | Dya-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dya-Mir-2-P1-v1 Dya-Mir-2-P2a Dya-Mir-2-P2b1 Dya-Mir-2-P2b2 Dya-Mir-2-P3a Dya-Mir-2-P3b Dya-Mir-2-P4a-v1 Dya-Mir-2-P4b-v1 Dya-Mir-2-P5 Dya-Mir-2-P6a Dya-Mir-2-P6b Dya-Mir-2-P6c Dya-Mir-2-P8 Dya-Mir-2-P9-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-2-P7 Aga-Mir-2-P7 Asu-Mir-2-o7a Asu-Mir-2-o7b Bge-Mir-2-P7 Dan-Mir-2-P7 Dlo-Mir-2-P7 Dme-Mir-2-P7 Dmo-Mir-2-P7 Dsi-Mir-2-P7 Gpa-Mir-2-P7 Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P7 Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
3R: 6285780-6285840 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P7) |
Mir-29-P2h
3R: 6285189-6285285 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2-P7 3R: 6285780-6285840 [-] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCCAUUAGUUCUCCAUGAGGCGCACUUGUCAAGAACUUUCUCUGUGACCUGCGUGUACUUAAAAGCCGCAUCACAGUCUGAGUUCUUGCUGAGCGCGAAAUCCUCAAAGCAACAUAAAGCGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCCAUUAGUUCUCCAU- GG-| A U UCU CC CGUGUACU GA CGC CUUG CAAGAACUU CUGUGA UG \ CU GCG GAGU GUUCUUGAG GACACU AC U CGAAAUACAACGAAACUC AAA^ C C UCU -- GCCGAAAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dya-Mir-2-P7_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAAGAACUUUCUCUGUGACCUG -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dya-Mir-2-P7_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0009123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CAUCACAGUCUGAGUUCUUGCU -61
Get sequence
|