| MirGeneDB ID | War-Mir-2-P12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Wirenia (Solenogaster) (Wirenia argentea) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | War-Mir-2-o93 War-Mir-2-o94 War-Mir-2-o95 War-Mir-2-o96 War-Mir-2-o97 War-Mir-2-o98 War-Mir-2-o99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-2-P12a Agr-Mir-2-P12b Agr-Mir-2-P12c Agr-Mir-2-P12d Agr-Mir-2-P12e Agr-Mir-2-P12f1 Agr-Mir-2-P12f2 Cte-Mir-2-P12 Dgr-Mir-2-P12 Efe-Mir-2-P12f Efe-Mir-2-P12g Esc-Mir-2-P12 Gsp-Mir-2 Hru-Mir-2-P12 Lgi-Mir-2-P12a Lgi-Mir-2-P12b Lgi-Mir-2-P12c Lgi-Mir-2-P12d Lgi-Mir-2-P12e Lhy-Mir-2-P12 Llo-Mir-2-P12 Mgi-Mir-2-P12 Mom-Mir-2-P12f Mom-Mir-2-P12g Mom-Mir-2-P12h Mom-Mir-2-P12i Mom-Mir-2-P12j Mom-Mir-2-P12k Npo-Mir-2-P12 Obi-Mir-2-P12 Ofu-Mir-2-P12 Ovu-Mir-2-P12 Pau-Mir-2-P12 Pdu-Mir-2-P12 Ple-Mir-2 Pve-Mir-2-P12 Rph-Mir-2-P12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_025802215.1_ASM2580221v1_Wirenia) |
WNLI01003363.1: 16105-16164 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P12) |
Mir-71
WNLI01003363.1: 14091-14149 [+]
Ensembl
Mir-2-o93 WNLI01003363.1: 15447-15507 [+] Ensembl Mir-2-P12 WNLI01003363.1: 16105-16164 [+] Ensembl Mir-2-o94 WNLI01003363.1: 16422-16484 [+] Ensembl Mir-2-o95 WNLI01003363.1: 17073-17130 [+] Ensembl Mir-2-o96 WNLI01003363.1: 17457-17517 [+] Ensembl Mir-2-o97 WNLI01003363.1: 17735-17794 [+] Ensembl |
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| Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUGGGCCCACGAUAUUGUUGAGUAAUGUAGAGGUUCAGGUGGCUGUGAUGUGCCAUUAUCACAUCCAUAUCACAGCCUGCUUGGAUCACCUACGUUCUUAAUCACAUCACGUUCUCUCACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GUGGGCCCACGAUAUUG-- U A- -| CCAUUA UUGAG AAUGUAG GGUUCAGGU GGCUGUGAUGUG \ AAUUC UUGCAUC CUAGGUUCG CCGACACUAUAC U CACUCUCUUGCACUACACU - CA U^ CUACAC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | War-Mir-2-P12_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGUUCAGGUGGCUGUGAUGUG -22
Get sequence
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| Mature sequence | War-Mir-2-P12_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UAUCACAGCCUGCUUGGAUCACC -60
Get sequence
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