MirGeneDB 3.0

3 Ixodes scapularis microRNA genes of family MIR-2 (all species)
Sort by genome coordinates Motifs Tissue expression
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MirGeneDB ID MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) Iso­miR 3' NTU  UG  UGUG CNNC Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Sa Sa To
Isc-Mir-2-P1 isc-mir-2b MIR-2 AUCACAG None MIMAT0012697 NW_024609884.1 3130345 3130409 + Arthropoda Protostomia No 1
Isc-Mir-2-P3 None MIR-2 CAUCAAA None None NW_024609884.1 3130575 3130635 + Arthropoda Protostomia No 1
Isc-Mir-2-P4 isc-mir-2a MIR-2 AUCACAG None MIMAT0012696 NW_024609884.1 3130738 3130797 + Arthropoda Protostomia No 1 1

(red - mature/co-mature, blue - star)

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all

Download genome coordinates (GFF format)

Download count matrix