MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Pdu-Mir-124

Family name MIR-124 (all species)
Species Dumerils clam worm (Platynereis dumerilii)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Aae-Mir-124  Aca-Mir-124-P1-v1  Aca-Mir-124-P2-v1  Aca-Mir-124-P3-v1  Aca-Mir-124-P4-v1  Aga-Mir-124  Agr-Mir-124  Ami-Mir-124-P1-v1  Ami-Mir-124-P2-v1  Ami-Mir-124-P3-v1  Ami-Mir-124-P4-v1  Asu-Mir-124  Ava-Mir-124-P37  Ava-Mir-124-P38  Bfl-Mir-124  Bge-Mir-124  Bko-Mir-124  Bla-Mir-124  Bpl-Mir-124  Bta-Mir-124-P1-v1  Bta-Mir-124-P2-v1  Bta-Mir-124-P3-v1  Cbr-Mir-124-P9  Cbr-Mir-124-P10  Cbr-Mir-124-P11  Cel-Mir-124  Cfa-Mir-124-P1-v1  Cfa-Mir-124-P2-v1  Cfa-Mir-124-P3-v1  Cin-Mir-124-P7  Cin-Mir-124-P8  Cja-Mir-124-P1-v1  Cja-Mir-124-P2-v1  Cja-Mir-124-P3-v1  Cli-Mir-124-P1-v1  Cli-Mir-124-P3-v1  Cmi-Mir-124-P1-v1  Cmi-Mir-124-P2-v1  Cmi-Mir-124-P3-v1  Cmi-Mir-124-P4  Cpi-Mir-124-P1-v1  Cpi-Mir-124-P2-v1  Cpi-Mir-124-P3-v1  Cpi-Mir-124-P4-v1  Cpo-Mir-124-P1-v1  Cpo-Mir-124-P2-v1  Cpo-Mir-124-P3-v1  Csc-Mir-124-P25  Csc-Mir-124-P26  Cte-Mir-124  Dan-Mir-124  Dgr-Mir-124-P39  Dgr-Mir-124-P40  Dlo-Mir-124  Dma-Mir-124  Dme-Mir-124  Dmo-Mir-124  Dno-Mir-124-P1-v1  Dno-Mir-124-P2-v1  Dno-Mir-124-P3-v1  Dpu-Mir-124  Dre-Mir-124-P1a-v1  Dre-Mir-124-P1b-v1  Dre-Mir-124-P2a-v1  Dre-Mir-124-P3a-v1  Dre-Mir-124-P3b-v1  Dre-Mir-124-P4-v1  Dsi-Mir-124  Dya-Mir-124  Eba-Mir-124  Ebu-Mir-124-P5-v1  Ebu-Mir-124-P6-v1  Eca-Mir-124-P1-v1  Eca-Mir-124-P2-v1  Eca-Mir-124-P3-v1  Efe-Mir-124-P14  Efe-Mir-124-P15  Efe-Mir-124-P16  Efe-Mir-124-P17  Efe-Mir-124-P18  Egr-Mir-124-o8  Egr-Mir-124-o9  Esc-Mir-124  Ete-Mir-124-P1-v1  Ete-Mir-124-P2-v1  Gga-Mir-124-P1-v1  Gga-Mir-124-P2-v1  Gga-Mir-124-P3-v1  Gga-Mir-124-P4-v1  Gja-Mir-124-P1-v1  Gja-Mir-124-P2-v1  Gja-Mir-124-P3-v1  Gja-Mir-124-P4-v1  Gmo-Mir-124-P1a-v1  Gmo-Mir-124-P1b-v1  Gmo-Mir-124-P3a-v1  Gmo-Mir-124-P3b-v1  Gmo-Mir-124-P4-v1  Gpa-Mir-124  Gsa-Mir-124-o6  Gsa-Mir-124-o7  Gsp-Mir-124  Hme-Mir-124  Hmi-Mir-124-P41  Hmi-Mir-124-P42  Hmi-Mir-124-P43  Hru-Mir-124  Hsa-Mir-124-P1-v1  Hsa-Mir-124-P2-v1  Hsa-Mir-124-P3-v1  Isc-Mir-124  Laf-Mir-124-P1-v1  Laf-Mir-124-P2-v1  Laf-Mir-124-P3-v1  Lan-Mir-124  Lch-Mir-124-P1  Lch-Mir-124-P2  Lch-Mir-124-P3  Lch-Mir-124-P4  Lgi-Mir-124-P12  Lgi-Mir-124-P13  Lhy-Mir-124  Llo-Mir-124  Loc-Mir-124-P1-v1  Loc-Mir-124-P2-v1  Loc-Mir-124-P3-v1  Loc-Mir-124-P4-v1  Lpo-Mir-124-P19  Lpo-Mir-124-P20  Lpo-Mir-124-P21  Lpo-Mir-124-P22  Lpo-Mir-124-P23  Lpo-Mir-124-P24  Mal-Mir-124-P1a-v1  Mal-Mir-124-P1b-v1  Mal-Mir-124-P2a-v1  Mal-Mir-124-P3a-v1  Mal-Mir-124-P3b-v1  Mal-Mir-124-P4-v1  Mdo-Mir-124-P1-v1  Mdo-Mir-124-P2-v1  Mdo-Mir-124-P3-v1  Mgi-Mir-124  Mml-Mir-124-P1-v1  Mml-Mir-124-P2-v1  Mml-Mir-124-P3-v1  Mmr-Mir-124-P1-v1  Mmr-Mir-124-P2-v1  Mmr-Mir-124-P3-v1  Mmu-Mir-124-P1-v1  Mmu-Mir-124-P2-v1  Mmu-Mir-124-P3-v1  Mom-Mir-124  Mun-Mir-124-P1-v1  Mun-Mir-124-P2-v1  Mun-Mir-124-P3-v1  Mun-Mir-124-P4-v1  Neu-Mir-124-P1-v1  Neu-Mir-124-P2-v1  Neu-Mir-124-P3-v1  Npo-Mir-124  Oan-Mir-124-P1-v1  Oan-Mir-124-P3-v1  Oan-Mir-124-P4-v1  Obi-Mir-124  Ocu-Mir-124-P1-v1  Ocu-Mir-124-P2-v1  Ocu-Mir-124-P3-v1  Ofu-Mir-124  Ovu-Mir-124  Pab-Mir-124-P1-v1  Pab-Mir-124-P2-v1  Pab-Mir-124-P3-v1  Pau-Mir-124  Pbv-Mir-124-P1-v1  Pbv-Mir-124-P2-v1  Pbv-Mir-124-P3-v1  Pbv-Mir-124-P4a  Pbv-Mir-124-P4b-v1  Pcr-Mir-124-o4  Pcr-Mir-124-o5  Pfl-Mir-124  Pma-Mir-124-o1  Pma-Mir-124-o2  Pma-Mir-124-o3  Pmi-Mir-124  Pve-Mir-124  Rno-Mir-124-P1-v1  Rno-Mir-124-P2-v1  Rno-Mir-124-P3-v1  Rph-Mir-124-P27  Rph-Mir-124-P28  Sha-Mir-124-P1-v1  Sha-Mir-124-P2-v1  Sha-Mir-124-P3-v1  Sko-Mir-124  Sma-Mir-124  Sme-Mir-124-P29  Sme-Mir-124-P30  Sme-Mir-124-P31a  Sme-Mir-124-P31b  Sme-Mir-124-P32  Sme-Mir-124-P33  Sme-Mir-124-P34  Sne-Mir-124  Snu-Mir-124  Spt-Mir-124-P1  Spt-Mir-124-P2  Spt-Mir-124-P3e  Spt-Mir-124-P3f  Spt-Mir-124-P4  Spu-Mir-124  Sro-Mir-124  Sto-Mir-124-P1-v1  Sto-Mir-124-P2-v1  Sto-Mir-124-P3-v1  Sto-Mir-124-P4-v1  Tca-Mir-124  Tgu-Mir-124-P1-v1  Tgu-Mir-124-P2-v1  Tgu-Mir-124-P3-v1  Tni-Mir-124-P1b-v1  Tni-Mir-124-P2a-v1  Tni-Mir-124-P2b-v1  Tni-Mir-124-P4-v1  Tur-Mir-124-P46  Tur-Mir-124-P47  War-Mir-124  Xbo-Mir-124  Xla-Mir-124-P1c-v1  Xla-Mir-124-P1d-v1  Xla-Mir-124-P2c-v1  Xla-Mir-124-P2d-v1  Xla-Mir-124-P3c-v1  Xla-Mir-124-P3d-v1  Xtr-Mir-124-P1-v1  Xtr-Mir-124-P2-v1  Xtr-Mir-124-P3-v1 
Node of Origin (locus) Bilateria
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(GCA_026936325.1_EMBL_pdum_1.0)		 JAPTHN010000001.1: 63283531-63283587 [-] Ensembl
Seed AAGGCAC
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)		 
UCUUGUAGAACAAACGUGGGUUUUCUCUGAGUGUUCACUGUGUACGCCUUGGUGUGUGGUAACUAUUAAGGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGAUAGCCCUCAUGCGACAGAAAUAUCG
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30        40        50         
UCUUGUAGAACAAACGU--|    U     GA             AC        GUGUG 
                   GGGUU UCUCU  GUGUUCACUGUGU  GCCUUGGU     \
                   CCCGA AGAGA  CGUAAGUGGCGCA  CGGAAUUA     G
GCUAUAAAGACAGCGUACU^    U     AC             --        UCAAU 
     110       100        90        80          70        60
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsUG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17), UGUG in loop
Tissue expression
- +
24 24 24 24 24 36 36 36 36 36 48 48 48 48 48 6d 6d 6d 6d 72 72 72 72 72
Star sequence

Pdu-Mir-124_5p* (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
0- GUGUUCACUGUGUACGCCUUGGU -23
Get sequence
Mature sequence

Pdu-Mir-124_3p
mirBase accessionNone
Sequence 
36- UAAGGCACGCGGUGAAUGCCA -57
Get sequence