MirGeneDB ID | Pcr-Mir-124-o5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-124 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tiger flatworm (Prostheceraeus crozieri ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Pcr-Mir-124-o4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-124 Aga-Mir-124 Agr-Mir-124 Asu-Mir-124 Bfl-Mir-124 Bge-Mir-124 Bko-Mir-124 Bla-Mir-124 Bpl-Mir-124 Cel-Mir-124 Cte-Mir-124 Dan-Mir-124 Dlo-Mir-124 Dma-Mir-124 Dme-Mir-124 Dmo-Mir-124 Dpu-Mir-124 Dsi-Mir-124 Dya-Mir-124 Eba-Mir-124 Ebu-Mir-124-P5-v1 Esc-Mir-124 Gpa-Mir-124 Gsp-Mir-124 Hme-Mir-124 Hru-Mir-124 Isc-Mir-124 Lan-Mir-124 Lhy-Mir-124 Llo-Mir-124 Mgi-Mir-124 Mom-Mir-124 Npo-Mir-124 Obi-Mir-124 Ofu-Mir-124 Ovu-Mir-124 Pau-Mir-124 Pdu-Mir-124 Pfl-Mir-124 Pmi-Mir-124 Pve-Mir-124 Sko-Mir-124 Sma-Mir-124 Sne-Mir-124 Snu-Mir-124 Spu-Mir-124 Sro-Mir-124 Tca-Mir-124 War-Mir-124 Xbo-Mir-124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | P. crozeri | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_907163375.1_PROCRO_GENOME_genomic) |
CAJQUW010012883.1: 1244644-1244702 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUGCGAUGAUAAACUCGACCAACCAGUCUGGCAUUCUCUGUUUGACCUUGAUGAGCCCUGAUUACUAUUAAGGCACGCGGUGAAUGCCAACGUGGUUCGAGAGAGCAACUCAAACUUCCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CUGCGAUGAUAAACUCGACC-- -| C U U A GAGCCC AACCA GU UGGCAUUC CUGU UG CCUUGAU U UUGGU CA ACCGUAAG GGCG AC GGAAUUA G CCUUCAAACUCAACGAGAGAGC G^ - U C - UCAUUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Pcr-Mir-124-o5_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GCAUUCUCUGUUUGACCUUGAU -22
Get sequence
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Mature sequence | Pcr-Mir-124-o5_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UAAGGCACGCGGUGAAUGCCA -59
Get sequence
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