| MirGeneDB ID | Efe-Mir-124-P16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-124 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Common brandling worm (Eisenia fetida) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Efe-Mir-124-P15 Efe-Mir-124-P17 Efe-Mir-124-P18 Efe-Mir-124-P19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-124 Asu-Mir-124 Bfl-Mir-124 Bge-Mir-124 Bla-Mir-124 Cel-Mir-124 Cte-Mir-124 Dan-Mir-124 Dma-Mir-124 Dme-Mir-124 Dmo-Mir-124 Dpu-Mir-124 Dsi-Mir-124 Dya-Mir-124 Esc-Mir-124 Hme-Mir-124 Isc-Mir-124 Lan-Mir-124 Npo-Mir-124 Obi-Mir-124 Ovu-Mir-124 Pfl-Mir-124 Pmi-Mir-124 Sko-Mir-124 Spu-Mir-124 Tca-Mir-124 Xbo-Mir-124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | E. fetida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Efe_combined) |
Efet.01.61867: 2146-2211 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUUCCAGCAACGAUUAUUUGUCCACCUGUCGACGUUCACUGCGCUUGCCUUGAUGUGCCGCUUCUGGUAGAAAUUAAGGCACGCGGUGAAUGCCAACAUGUGAAUGCCGAUACGUGAAAGCGACAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUUCCAGCAACGAUUAUUUGUC--| C CGA CU GUGCCGCU CAC UGU CGUUCACUGCG UGCCUUGAU U GUG ACA GUAAGUGGCGC ACGGAAUUA C UACAGCGAAAGUGCAUAGCCGUAA^ U ACC -- AAGAUGGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Efe-Mir-124-P16_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GACGUUCACUGCGCUUGCCUUGAU -24
Get sequence
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| Mature sequence | Efe-Mir-124-P16_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- UAAGGCACGCGGUGAAUGCCAA -66
Get sequence
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