MirGeneDB 2.1
MirGeneDB ID

Dma-Mir-36

Family name MIR-36 (all species)
Seed CACCGGG
Species Large common water flea (Daphnia magna)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Asu-Mir-36-o27  Asu-Mir-36-o28  Asu-Mir-36-o29-v1  Asu-Mir-36-o29-v2  Asu-Mir-36-o30  Asu-Mir-36-o31  Asu-Mir-36-o32  Bge-Mir-36  Bpl-Mir-36-P17  Bpl-Mir-36-P18  Bpl-Mir-36-P19  Cbr-Mir-36-o1  Cbr-Mir-36-o2  Cbr-Mir-36-o3  Cbr-Mir-36-o4  Cbr-Mir-36-o5  Cbr-Mir-36-o6  Cbr-Mir-36-o7a  Cbr-Mir-36-o7b  Cbr-Mir-36-o7c  Cbr-Mir-36-o8a  Cbr-Mir-36-o8b  Cbr-Mir-36-o8c  Cbr-Mir-36-o9  Cbr-Mir-36-o10  Cbr-Mir-36-o11  Cbr-Mir-36-o12  Cbr-Mir-36-o13  Cbr-Mir-36-o14  Cbr-Mir-36-o15  Cbr-Mir-36-o16  Cbr-Mir-36-o17  Cbr-Mir-36-o18  Cbr-Mir-36-o19  Cbr-Mir-36-o20  Cbr-Mir-36-o21  Cbr-Mir-36-o22  Cbr-Mir-36-o23  Cbr-Mir-36-o24  Cbr-Mir-36-o25  Cbr-Mir-36-o26  Cel-Mir-36-P1  Cel-Mir-36-P2  Cel-Mir-36-P3  Cel-Mir-36-P4  Cel-Mir-36-P5  Cel-Mir-36-P6  Cel-Mir-36-P7  Cel-Mir-36-P8  Cgi-Mir-36  Cte-Mir-36  Dpu-Mir-36  Efe-Mir-36-P9  Efe-Mir-36-P10  Esc-Mir-36-P14  Esc-Mir-36-P15  Isc-Mir-36  Lpo-Mir-36-P11  Lpo-Mir-36-P12  Lpo-Mir-36-P13  Npo-Mir-36  Obi-Mir-36-P14  Obi-Mir-36-P15  Ovu-Mir-36-P14  Ovu-Mir-36-P15  Sme-Mir-36-P20  Sme-Mir-36-P21  Sme-Mir-36-P22  Tca-Mir-36 
Node of Origin (locus) Protostomia
Node of Origin (family) Protostomia
Genome context
(DMA_ASM399081)		 NC_046175.1: 6285796-6285856 [-] Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
UGUAGUUUCCCACAGUUCCUUGGUAUUUGUCGGUGAAUUCGACCAUGGUUUUGUUGAUUUAGAGAAACAUCACCGGGUAGAAUUCAUCCAGAACUAUCAAGCUUAAUGCUUCUGUUAUUGG
Get precursor sequence
Structure
        10          20         30        40        50        60
UGUAGUUUCCCACAGUUC--       -|  GUC         G   A    UU  UUGAUU 
                    CUUGGUA UUU   GGUGAAUUC ACC UGGU  UG      U
                    GAACUAU AAG   CUACUUAAG UGG GCCA  AC      A
GGUUAUUGUCUUCGUAAUUC       C^  AC-         A   -    CU  AAAGAG 
 .       110       100        90         80         70
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsCNNC at 3p(+17)
Tissue expression
-   +
01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14
Star sequence

Dma-Mir-36_5p*
mirBase accessionNone
Sequence 
0- CGGUGAAUUCGACCAUGGUUUUG -23
Get sequence
Mature sequence

Dma-Mir-36_3p
mirBase accessionNone
Sequence 
39- UCACCGGGUAGAAUUCAUCCAG -61
Get sequence