MirGeneDB 2.1
MirGeneDB ID

Bge-Mir-36

Family name MIR-36 (all species)
Seed GUGGAUU
Species Cockroach (Blattella germanica)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Asu-Mir-36-o27  Asu-Mir-36-o28  Asu-Mir-36-o29-v1  Asu-Mir-36-o29-v2  Asu-Mir-36-o30  Asu-Mir-36-o31  Asu-Mir-36-o32  Bpl-Mir-36-P17  Bpl-Mir-36-P18  Bpl-Mir-36-P19  Cbr-Mir-36-o1  Cbr-Mir-36-o2  Cbr-Mir-36-o3  Cbr-Mir-36-o4  Cbr-Mir-36-o5  Cbr-Mir-36-o6  Cbr-Mir-36-o7a  Cbr-Mir-36-o7b  Cbr-Mir-36-o7c  Cbr-Mir-36-o8a  Cbr-Mir-36-o8b  Cbr-Mir-36-o8c  Cbr-Mir-36-o9  Cbr-Mir-36-o10  Cbr-Mir-36-o11  Cbr-Mir-36-o12  Cbr-Mir-36-o13  Cbr-Mir-36-o14  Cbr-Mir-36-o15  Cbr-Mir-36-o16  Cbr-Mir-36-o17  Cbr-Mir-36-o18  Cbr-Mir-36-o19  Cbr-Mir-36-o20  Cbr-Mir-36-o21  Cbr-Mir-36-o22  Cbr-Mir-36-o23  Cbr-Mir-36-o24  Cbr-Mir-36-o25  Cbr-Mir-36-o26  Cel-Mir-36-P1  Cel-Mir-36-P2  Cel-Mir-36-P3  Cel-Mir-36-P4  Cel-Mir-36-P5  Cel-Mir-36-P6  Cel-Mir-36-P7  Cel-Mir-36-P8  Cgi-Mir-36  Cte-Mir-36  Dma-Mir-36  Dpu-Mir-36  Efe-Mir-36-P9  Efe-Mir-36-P10  Esc-Mir-36-P14  Esc-Mir-36-P15  Isc-Mir-36  Lpo-Mir-36-P11  Lpo-Mir-36-P12  Lpo-Mir-36-P13  Npo-Mir-36  Obi-Mir-36-P14  Obi-Mir-36-P15  Ovu-Mir-36-P14  Ovu-Mir-36-P15  Sme-Mir-36-P20  Sme-Mir-36-P21  Sme-Mir-36-P22  Tca-Mir-36 
Node of Origin (locus) Protostomia
Node of Origin (family) Protostomia
Genome context
(Bger_2.0)		 KZ614999.1: 58272-58329 [-] Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
CUCUUACAUCUGUGUUUCCUCGAGUUUAAUAGUGGAUUCUUUCUUGGGAAUGAGAACAACAUAUCCAUCACCGGAAGGAAUCCACAGUUAAACUUCAGACUGCAACAUCCGAAGAUCA
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30        40        50         
CUCUUACAUCUGUGUUUC--| C         A             U  GA   AGAACA 
                    CU GAGUUUAAU GUGGAUUCUUUCU GG  AUG      \
                    GA UUCAAAUUG CACCUAAGGAAGG CC  UAC      A
ACUAGAAGCCUACAACGUCA^ C         A             -  AC   CUAUAC 
      110       100        90        80         70        60
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsCNNC at 3p(+17)
Tissue expression
-   +
Ad Ad Ny Ny Ny Ny Ny Ny Ny Ny Ov Co Co Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em No No
Mature sequence

Bge-Mir-36_5p
mirBase accessionNone
Sequence 
0- AGUGGAUUCUUUCUUGGGAAUGA -23
Get sequence
Co-mature sequence

Bge-Mir-36_3p
mirBase accessionNone
Sequence 
36- AUCACCGGAAGGAAUCCACAGU -58
Get sequence