MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Bko-Mir-137

Family name MIR-137 (all species)
Species Monogonont Rotifer 2 (Brachionus koreanus)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Aae-Mir-137-P11  Aae-Mir-137-P12  Aca-Mir-137-P1-v1  Aca-Mir-137-P3-v1  Aga-Mir-137  Agr-Mir-137  Ami-Mir-137-P1-v1  Ami-Mir-137-P3-v1  Asu-Mir-137  Ava-Mir-137  Bfl-Mir-137  Bge-Mir-137-P13-v1  Bge-Mir-137-P14-v1  Bla-Mir-137-P15a  Bla-Mir-137-P15b  Bla-Mir-137-P15c  Bpl-Mir-137  Bta-Mir-137-P1-v1  Cbr-Mir-137  Cel-Mir-137  Cfa-Mir-137-P1-v1  Cja-Mir-137-P1-v1  Cli-Mir-137-P1-v1  Cli-Mir-137-P3  Cmi-Mir-137-P1  Cpi-Mir-137-P1-v1  Cpi-Mir-137-P3-v1  Csc-Mir-137-P21  Csc-Mir-137-P22  Cte-Mir-137  Dan-Mir-137  Dgr-Mir-137  Dma-Mir-137  Dme-Mir-137  Dmo-Mir-137  Dno-Mir-137-P1-v1  Dpu-Mir-137  Dre-Mir-137-P1a-v1  Dre-Mir-137-P1b-v1  Dsi-Mir-137  Dya-Mir-137  Eba-Mir-137  Ebu-Mir-137  Eca-Mir-137-P1  Efe-Mir-137-P4  Efe-Mir-137-P5  Efe-Mir-137-P6  Efe-Mir-137-P7  Efe-Mir-137-P8  Efe-Mir-137-P9  Efe-Mir-137-P10  Esc-Mir-137  Ete-Mir-137-P1-v1  Gga-Mir-137-P1-v1  Gga-Mir-137-P3-v1  Gja-Mir-137-P1-v1  Gja-Mir-137-P3  Gmo-Mir-137-P1b-v1  Gmo-Mir-137-P3a-v1  Gmo-Mir-137-P3b-v1  Gpa-Mir-137  Hme-Mir-137  Hru-Mir-137  Hsa-Mir-137-P1-v1  Isc-Mir-137  Laf-Mir-137-P1  Lan-Mir-137  Lch-Mir-137-P1  Lch-Mir-137-P3  Lgi-Mir-137  Lhy-Mir-137  Llo-Mir-137  Loc-Mir-137-P1-v1  Loc-Mir-137-P3-v1  Lpo-Mir-137-P16  Lpo-Mir-137-P17  Lpo-Mir-137-P18  Lpo-Mir-137-P19  Lpo-Mir-137-P20  Mal-Mir-137-P1b-v1  Mal-Mir-137-P3a-v1  Mal-Mir-137-P3b-v1  Mdo-Mir-137-P1-v1  Mdo-Mir-137-P3-v1  Mgi-Mir-137  Mml-Mir-137-P1-v1  Mmr-Mir-137-P1  Mmu-Mir-137-P1-v1  Mom-Mir-137  Mun-Mir-137-P1  Mun-Mir-137-P3  Neu-Mir-137-P1  Neu-Mir-137-P3  Oan-Mir-137-P1-v1  Oan-Mir-137-P3-v1  Obi-Mir-137  Ocu-Mir-137-P1-v1  Ofu-Mir-137  Ovu-Mir-137-v1  Pab-Mir-137-P1-v1  Pau-Mir-137  Pbv-Mir-137-P1-v1  Pbv-Mir-137-P3-v1  Pca-Mir-137  Pdu-Mir-137  Pfl-Mir-137-v1  Pma-Mir-137-o1  Pma-Mir-137-o2  Pma-Mir-137-o3  Pmi-Mir-137-v1  Pve-Mir-137  Rno-Mir-137-P1-v1  Rph-Mir-137  Sha-Mir-137-P1-v1  Sha-Mir-137-P3  Sko-Mir-137  Snu-Mir-137  Spt-Mir-137-P1  Spu-Mir-137  Sto-Mir-137-P1  Tca-Mir-137-v1  Tgu-Mir-137-P1-v1  Tni-Mir-137-P3b  Tur-Mir-137  War-Mir-137  Xbo-Mir-137  Xla-Mir-137-P1  Xtr-Mir-137-P1 
Node of Origin (locus) Bilateria
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(Brachionus_koreanusGCA_016987375.1_Bk_v0.5.4_genomic)		 PJRA01000263.1: 3970253-3970327 [-] Ensembl
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-137)		 Mir-137 PJRA01000263.1: 3970253-3970327 [-] Ensembl
Mir-22-P1 PJRA01000263.1: 3983247-3983308 [-] Ensembl
Seed UUAUUGC
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)		 
ACAGCGGGUCAUGGUUGCUUUAACUGAAUCCGUGUAUUCAAUAGCAAUAAAUAAUAGCUGAAAGUGGGCCUUAAAGCCAAUUAUUAUUGCUGUAGAAUAUACAUAUUUUCUAAAGCGAUUCAACAAUUCAAGAUA
Get precursor sequence
Structure
        10           20        30        40        50        60       
ACAGCGGGUCAUGGUUG---|    ACU    CC        A          AUAAUAGCUGAAAGUG 
                    CUUUA   GAAU  GUGUAUUC AUAGCAAUAA                \
                    GAAAU   UUUA  CAUAUAAG UGUCGUUAUU                G
AUAGAACUUAACAACUUAGC^    CU-    UA        A          AUUAACCGAAAUUCCG 
   130       120       110        100        90        80        70
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU Unknown
MotifsCNNC at 3p(+17)
Tissue expression
- +
To To To
Star sequence

Bko-Mir-137_5p* (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
0- CGUGUAUUCAAUAGCAAUAAAUAA -24
Get sequence
Mature sequence

Bko-Mir-137_3p
mirBase accessionNone
Sequence 
52- AUUAUUGCUGUAGAAUAUACAUA -75
Get sequence