MirGeneDB ID | Lpo-Mir-137-P18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Lpo-Mir-137-P16 Lpo-Mir-137-P17 Lpo-Mir-137-P19 Lpo-Mir-137-P20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Mir-137 Agr-Mir-137 Asu-Mir-137 Ava-Mir-137 Bfl-Mir-137 Bko-Mir-137 Bpl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dgr-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Eba-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gpa-Mir-137 Hme-Mir-137 Hru-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lgi-Mir-137 Lhy-Mir-137 Llo-Mir-137 Mgi-Mir-137 Mom-Mir-137 Obi-Mir-137 Ofu-Mir-137 Pau-Mir-137 Pca-Mir-137 Pdu-Mir-137 Pve-Mir-137 Rph-Mir-137 Sko-Mir-137 Snu-Mir-137 Spu-Mir-137 Tur-Mir-137 War-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013665870.1: 589199-589257 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAUUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAAGAGCUGUAUGCCACUUGUGUUACUGUGUGUAUUCUUGGGUGAAUAACACUGUUAUUGGUUGCUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUGGUUAGCGAGUCCGAUCAACGCAACUUGACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CCAAGAGCUGUAUGCCA---| GUU UG UG G CUGUUA CUUGU AC UGUGUAUUCU GGU AAUAACA U GAGCG UG GCACAUAAGA UCG UUAUUGU U CAGUUCAACGCAACUAGCCU^ AU- GU GU - CGUUGG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Lpo-Mir-137-P18_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUGUAUUCUUGGGUGAAUAACA -22
Get sequence
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Mature sequence | Lpo-Mir-137-P18_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UUAUUGCUUGAGAAUACACGU -59
Get sequence
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