MirGeneDB

MirGeneDB ID

Lgi-Mir-137

Family name MIR-137 (all species)
Seed AUUGCUU
Species Owl limpet (Lottia gigantea)
MiRBase ID lgi-mir-137
Paralogues
Orthologues Aae-Mir-137-P11  Aae-Mir-137-P12  Aca-Mir-137-P1-v1  Aca-Mir-137-P1-v2  Aca-Mir-137-P2  Ami-Mir-137-P1-v1  Ami-Mir-137-P1-v2  Ami-Mir-137-P2  Asu-Mir-137  Bfl-Mir-137  Bge-Mir-137-P13-v1  Bge-Mir-137-P13-v2  Bge-Mir-137-P14-v1  Bge-Mir-137-P14-v2  Bta-Mir-137-P1-v1  Bta-Mir-137-P1-v2  Cbr-Mir-137  Cel-Mir-137  Cfa-Mir-137-P1-v1  Cfa-Mir-137-P1-v2  Cgi-Mir-137  Cli-Mir-137-P1-v1  Cli-Mir-137-P1-v2  Cli-Mir-137-P2  Cpi-Mir-137-P1-v1  Cpi-Mir-137-P1-v2  Cpi-Mir-137-P2  Cte-Mir-137  Dan-Mir-137  Dme-Mir-137  Dmo-Mir-137  Dno-Mir-137-P1-v1  Dno-Mir-137-P1-v2  Dpu-Mir-137  Dre-Mir-137-P1a-v1  Dre-Mir-137-P1a-v2  Dre-Mir-137-P1b-v1  Dre-Mir-137-P1b-v2  Efe-Mir-137-P4  Efe-Mir-137-P5  Efe-Mir-137-P6  Efe-Mir-137-P7  Efe-Mir-137-P8  Efe-Mir-137-P9  Efe-Mir-137-P10  Ete-Mir-137-P1-v1  Ete-Mir-137-P1-v2  Gga-Mir-137-P1-v1  Gga-Mir-137-P1-v2  Hme-Mir-137  Hsa-Mir-137-P1-v1  Hsa-Mir-137-P1-v2  Isc-Mir-137  Lan-Mir-137  Mdo-Mir-137-P1-v1  Mdo-Mir-137-P1-v2  Mdo-Mir-137-P2  Mml-Mir-137-P1-v1  Mml-Mir-137-P1-v2  Mmu-Mir-137-P1-v1  Mmu-Mir-137-P1-v2  Oan-Mir-137-P1-v1  Oan-Mir-137-P1-v2  Oan-Mir-137-P2  Ocu-Mir-137-P1-v1  Ocu-Mir-137-P1-v2  Pfl-Mir-137-v1  Pfl-Mir-137-v2  Pmi-Mir-137-v1  Pmi-Mir-137-v2  Rno-Mir-137-P1-v1  Rno-Mir-137-P1-v2  Sha-Mir-137-P1-v1  Sha-Mir-137-P1-v2  Sha-Mir-137-P2  Sko-Mir-137  Spu-Mir-137  Sto-Mir-137-P1  Tca-Mir-137-v1  Tca-Mir-137-v2  Tgu-Mir-137-P1-v1  Tgu-Mir-137-P1-v2  Xtr-Mir-137-P1c  Xtr-Mir-137-P1d  Xtr-Mir-137-P1e 
Node of Origin (locus) Bilateria
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(Lotgi1)
LOTGIsca_112: 765709-765768 [+] Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
AAGACAUUUUUGACUAGAGCCUGGCCGACUACGAGUAUUCUUGGGUGAAUAAUACUAUAUAAGCGUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAAUUGCCUUGGUUUCCACGGCAACAAUGGUGA
Get precursor sequence
Structure
        10          20         30        40        50          
AAGACAUUUUUGACUAG--    U-|  C  C    A       UG   G      ACUAUA 
                   AGCC  GGC GA UACG GUAUUCU  GGU AAUAAU      \
                   UUGG  CCG UU AUGC CAUAAGA  UCG UUAUUG      U
AGUGGUAACAACGGCACCU    UU^  -  A    A       GU   -      UGCGAA 
.       110       100         90        80         70
Deep sequencing
3' NTU Unknown
MotifsCNNC at 3p(+17)
Tissue expression
 +
To
Star sequence

Lgi-Mir-137_5p* (predicted)

MirBase accessionNone
Sequence
0- ACGAGUAUUCUUGGGUGAAUAAU -23
Get sequence
Mature sequence

Lgi-Mir-137_3p (predicted)

MirBase accessionMIMAT0009581
Sequence
38- UAUUGCUUGAGAAUACACGUAA -60
Get sequence