MirGeneDB ID | Bla-Mir-137-P15b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | European lancelet (Branchiostoma lanceolatum) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bla-Mir-137-P15a Bla-Mir-137-P15c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Mir-137 Agr-Mir-137 Asu-Mir-137 Ava-Mir-137 Bfl-Mir-137 Bko-Mir-137 Bpl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dgr-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Eba-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gpa-Mir-137 Hme-Mir-137 Hru-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lgi-Mir-137 Lhy-Mir-137 Llo-Mir-137 Mgi-Mir-137 Mom-Mir-137 Obi-Mir-137 Ofu-Mir-137 Pau-Mir-137 Pca-Mir-137 Pdu-Mir-137 Pve-Mir-137 Rph-Mir-137 Sko-Mir-137 Snu-Mir-137 Spu-Mir-137 Tur-Mir-137 War-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | B. lanceolatum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (BraLan2) |
xpSc0039671: 309797-309856 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-137-P15b) |
Mir-137-P15b
xpSc0039671: 309797-309856 [-]
Ensembl
Mir-137-P15a xpSc0039671: 313395-313454 [-] Ensembl |
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Seed | AUUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCGUUGCAGAUACAUACGCACUGCUCGGUCACGGGUAUUCUUGGGUUAAUAAUAUACUUUUUCUAUAUUAUUGCUUGAGAAUACACGUGACUGAGUGUGUGUGAGACUCGACGCGGGAGGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CCGUUGCAGAUACAUAC- -| G UG U AUACUU GCAC UGCUCGGUCACG GUAUUCU GGU AAUAAU \ UGUG GUGAGUCAGUGC CAUAAGA UCG UUAUUA U GGAGGGCGCAGCUCAGAG U^ A GU - UAUCUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Bla-Mir-137-P15b_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACGGGUAUUCUUGGGUUAAUAAU -23
Get sequence
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Mature sequence | Bla-Mir-137-P15b_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UAUUGCUUGAGAAUACACGUGA -60
Get sequence
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