| MirGeneDB ID | Efe-Mir-137-P9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Common brandling worm (Eisenia fetida) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Efe-Mir-137-P4 Efe-Mir-137-P5 Efe-Mir-137-P6 Efe-Mir-137-P7 Efe-Mir-137-P8 Efe-Mir-137-P10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-137 Bfl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cgi-Mir-137 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Hme-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lgi-Mir-137 Obi-Mir-137 Sko-Mir-137 Spu-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | E. fetida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Efe_combined) |
Efet.01.626403: 916-977 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCGAGACAGAGAACCAGCGCGCAGCUGAUCACGUGUAUUCUUAGGUAAAUAAUAUGGUGUGUUUUAUUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGUCAACUCGGCUCCUUCUGCUAAUGCUUCAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UCGAGACAGAGAACCAGCG---| C C C A AUGGUGU CG AG UGAU ACGUGUAUUCUUAGGUAA UAAU \ GC UC ACUG UGCACAUAAGAGUUCGUU AUUG G UACUUCGUAAUCGUCUUCCUCG^ - A A - UUAUUUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Efe-Mir-137-P9_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGUGUAUUCUUAGGUAAAUAAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Efe-Mir-137-P9_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UAUUGCUUGAGAAUACACGUAG -62
Get sequence
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