| MirGeneDB ID | Pmi-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Bat starfish (Patiria miniata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | pmi-mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aga-Mir-137 Agr-Mir-137 Asu-Mir-137 Ava-Mir-137 Bfl-Mir-137 Bko-Mir-137 Bpl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dgr-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Eba-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gpa-Mir-137 Hme-Mir-137 Hru-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lgi-Mir-137 Lhy-Mir-137 Llo-Mir-137 Mgi-Mir-137 Mom-Mir-137 Obi-Mir-137 Ofu-Mir-137 Ovu-Mir-137-v1 Pau-Mir-137 Pca-Mir-137 Pdu-Mir-137 Pfl-Mir-137-v1 Pve-Mir-137 Rph-Mir-137 Sko-Mir-137 Snu-Mir-137 Spu-Mir-137 Tca-Mir-137-v1 Tur-Mir-137 War-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Pmin1) |
JH769235.1: 38217-38276 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-137-v1) |
Mir-137-v1
JH769235.1: 38217-38276 [+]
Mir-137-v2 JH769235.1: 38217-38276 [+] |
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| Variant | Pmi-Mir-137-v1 |
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| Seed | AUUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGCCGGGACCCACUACAGAUCCCUUGAUUACGGGUAUUCUCGGGUUAAUAAUACAGUUAAUUGAUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGUGACGGGUUCCCACGUCGACAGCGGCUCUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGCCGGGACCCACUACA--| U UUG G U ACAGUU GA CCC AUUACG GUAUUCUCGGGU AAUAAU \ CU GGG UGAUGC CAUAAGAGUUCG UUAUUG A CUCUCGGCGACAGCUGCACC^ U CAG A - UAGUUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pmi-Mir-137-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGGGUAUUCUCGGGUUAAUAAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Pmi-Mir-137-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0032160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UAUUGCUUGAGAAUACACGUAG -60
Get sequence
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| Variant | Pmi-Mir-137-v2 |
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| Seed | UAUUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGCCGGGACCCACUACAGAUCCCUUGAUUACGGGUAUUCUCGGGUUAAUAAUACAGUUAAUUGAUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGUGACGGGUUCCCACGUCGACAGCGGCUCUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGCCGGGACCCACUACA--| U UUG G U CAGUU GA CCC AUUACG GUAUUCUCGGGU AAUAAUA \ CU GGG UGAUGC CAUAAGAGUUCG UUAUUGU A CUCUCGGCGACAGCUGCACC^ U CAG A - AGUUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pmi-Mir-137-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGGGUAUUCUCGGGUUAAUAAUA -24
Get sequence
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| Mature sequence | Pmi-Mir-137-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0032160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UUAUUGCUUGAGAAUACACGUAG -60
Get sequence
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