MirGeneDB 2.1
55 microRNA genes of family MIR-144
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Ami-Mir-144 ami-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0038167 MIMAT0038168 NW_017711222.1 62858 62915 - Vertebrata Vertebrata No 1
Cmi-Mir-144 None MIR-144 GAUAUCA None None KI635901.1 2886912 2886970 - Vertebrata Vertebrata No 1
Cpi-Mir-144 cpi-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0037770 MIMAT0037771 JH584690 7296122 7296179 + Vertebrata Vertebrata No 1
Dno-Mir-144 dno-mir-144 MIR-144 ACAGUAU MIMAT0047661 MIMAT0047662 JH563368 9611 9668 + Vertebrata Vertebrata No
Ete-Mir-144 None MIR-144 GAUAUCA None None JH980319 4842438 4842495 + Vertebrata Vertebrata No
Gga-Mir-144 gga-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0026644 MIMAT0003776 19 6010840 6010897 - Vertebrata Vertebrata No 1
Lch-Mir-144 None MIR-144 UACAGUA None None JH127350.1 728206 728264 - Vertebrata Vertebrata Unknown
Mdo-Mir-144 mdo-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0026669 MIMAT0004114 2 506777503 506777560 - Vertebrata Vertebrata No 1
Mml-Mir-144 mml-mir-144 MIR-144 GAUAUCA None MIMAT0006202 chr16 22890619 22890676 - Vertebrata Vertebrata No 1
Oan-Mir-144 oan-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0006902 MIMAT0006903 NC_041744.1 9165005 9165062 + Vertebrata Vertebrata No 1
Pbv-Mir-144 pbv-mir-144 MIR-144 UACAGUA MIMAT0038957 MIMAT0038958 KE957536.1 98855 98911 - Vertebrata Vertebrata No 1 1
Pma-Mir-144 pma-mir-144 MIR-144 ACAGUAU MIMAT0019474 MIMAT0019475 NC_046106.1 1186823 1186882 - Vertebrata Vertebrata No
Sha-Mir-144 None MIR-144 ACAGUAU None None GL857001.1 1655049 1655106 - Vertebrata Vertebrata No 1 1
Spt-Mir-144 None MIR-144 GAUAUCA None None QEPC01008384.1 2358679 2358736 + Vertebrata Vertebrata Unknown 1
Sto-Mir-144 None MIR-144 GAUAUCA None None BFAA01023372.1 8747 8805 + Vertebrata Vertebrata No
Tni-Mir-144 tni-mir-144 MIR-144 ACAGUAU None MIMAT0003021 7 2925543 2925603 - Vertebrata Vertebrata No 1
Xtr-Mir-144 xtr-mir-144 MIR-144 GAUAUCA None MIMAT0003687 chr2 26506546 26506603 + Vertebrata Vertebrata No 1
Aca-Mir-144-v1 aca-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0021771 MIMAT0021772 G889P68288RO14 342 398 - Vertebrata Vertebrata No
Bta-Mir-144-v1 bta-mir-144 MIR-144 ACAGUAU None MIMAT0009234 NC_037346.1 20238701 20238758 - Vertebrata Vertebrata No
Cfa-Mir-144-v1 cfa-mir-144 MIR-144 ACAGUAU None MIMAT0006734 chr9 43031036 43031093 - Vertebrata Vertebrata No
Cli-Mir-144-v1 None MIR-144 GAUAUCA None None SRR516967 48 105 + Vertebrata Vertebrata No 1
Cpo-Mir-144-v1 cpo-mir-144 MIR-144 ACAGUAU MIMAT0047012 MIMAT0047013 scaffold_32 23622352 23622409 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-144-v1 dre-mir-144 MIR-144 ACAGUAU MIMAT0031975 MIMAT0001841 chr5 42272092 42272150 - Vertebrata Vertebrata No 1
Ebu-Mir-144-v1 None MIR-144 ACAGUAU None None FYBX02009908.1 8547203 8547259 - Vertebrata Vertebrata No
Gja-Mir-144-v1 None MIR-144 ACAGUAU None None NW_015173122.1 2276609 2276665 - Vertebrata Vertebrata No 1
Gmo-Mir-144-v1 gmo-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0044027 MIMAT0044028 contig314418 343 401 + Vertebrata Vertebrata No 1
Hsa-Mir-144-v1 hsa-mir-144 MIR-144 ACAGUAU MIMAT0004600 MIMAT0000436 chr17 28861547 28861604 - Vertebrata Vertebrata No 1
Loc-Mir-144-v1 None MIR-144 ACAGUAU None None LG22 3766309 3766367 + Vertebrata Vertebrata No 1
Mal-Mir-144-v1 None MIR-144 GAUAUCA None None KV884735.1 275834 275892 + Vertebrata Vertebrata No 1
Mmu-Mir-144-v1 mmu-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0016988 MIMAT0000156 chr11 78073010 78073067 + Vertebrata Vertebrata No 1
Mun-Mir-144-v1 None MIR-144 GAUAUCA None None 144-v1_LR594644.1:58948985-58949242 101 158 + Vertebrata Vertebrata No
Ocu-Mir-144-v1 ocu-mir-144 MIR-144 ACAGUAU MIMAT0048249 MIMAT0048250 chr19 19330299 19330356 + Vertebrata Vertebrata No
Rno-Mir-144-v1 rno-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0017130 MIMAT0000850 chr10 65291378 65291435 - Vertebrata Vertebrata No
Tgu-Mir-144-v1 tgu-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0014650 MIMAT0014596 19 4217046 4217103 + Vertebrata Vertebrata No 1
Aca-Mir-144-v2 aca-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0021771 MIMAT0021772 G889P68288RO14 342 398 - Vertebrata Vertebrata No
Bta-Mir-144-v2 bta-mir-144 MIR-144 GAUAUCA None MIMAT0009234 NC_037346.1 20238701 20238758 - Vertebrata Vertebrata No
Cfa-Mir-144-v2 cfa-mir-144 MIR-144 GAUAUCA None MIMAT0006734 chr9 43031036 43031093 - Vertebrata Vertebrata No
Cli-Mir-144-v2 None MIR-144 GAUAUCA None None SRR516967 48 105 + Vertebrata Vertebrata No 1
Cpo-Mir-144-v2 cpo-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0047012 MIMAT0047013 scaffold_32 23622352 23622409 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-144-v2 dre-mir-144 MIR-144 UACAGUA MIMAT0031975 MIMAT0001841 chr5 42272092 42272150 - Vertebrata Vertebrata No 1
Ebu-Mir-144-v2 None MIR-144 UACAGUA None None FYBX02009908.1 8547203 8547259 - Vertebrata Vertebrata No
Gja-Mir-144-v2 None MIR-144 UACAGUA None None NW_015173122.1 2276609 2276665 - Vertebrata Vertebrata No 1
Gmo-Mir-144-v2 gmo-mir-144 MIR-144 UACAGUA MIMAT0044027 MIMAT0044028 contig314418 343 401 + Vertebrata Vertebrata No 1
Hsa-Mir-144-v2 hsa-mir-144 MIR-144 UACAGUA MIMAT0004600 MIMAT0000436 chr17 28861547 28861604 - Vertebrata Vertebrata No 1
Loc-Mir-144-v2 None MIR-144 UACAGUA None None LG22 3766309 3766367 + Vertebrata Vertebrata No 1
Mal-Mir-144-v2 None MIR-144 GAUAUCA None None KV884735.1 275834 275892 + Vertebrata Vertebrata No 1
Mmu-Mir-144-v2 mmu-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0016988 MIMAT0000156 chr11 78073010 78073067 + Vertebrata Vertebrata No 1
Mun-Mir-144-v2 None MIR-144 GAUAUCA None None 144-v1_LR594644.1:58948985-58949242 101 158 + Vertebrata Vertebrata No
Ocu-Mir-144-v2 ocu-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0048249 MIMAT0048250 chr19 19330299 19330356 + Vertebrata Vertebrata No
Rno-Mir-144-v2 rno-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0017130 MIMAT0000850 chr10 65291378 65291435 - Vertebrata Vertebrata No
Tgu-Mir-144-v2 tgu-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0014650 MIMAT0014596 19 4217046 4217103 + Vertebrata Vertebrata No 1
Xla-Mir-144-P1-v1 None MIR-144 GAUAUCA None None NC_030726.1 32856364 32856421 + X. laevis Vertebrata No 1 1
Xla-Mir-144-P1-v2 None MIR-144 ACAGUAU None None NC_030726.1 32856364 32856421 + X. laevis Vertebrata No 1 1
Xla-Mir-144-P2-v1 xla-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0046458 MIMAT0046459 NC_030727.1 4344085 4344142 - X. laevis Vertebrata No 1 1
Xla-Mir-144-P2-v2 xla-mir-144 MIR-144 ACAGUAU MIMAT0046458 MIMAT0046459 NC_030727.1 4344085 4344142 - X. laevis Vertebrata No 1 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all