MirGeneDB ID | Mun-Mir-489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-489 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-489-v1 Ami-Mir-489-v1 Bta-Mir-489-v1 Cfa-Mir-489 Cja-Mir-489 Cli-Mir-489-v1 Cpi-Mir-489-v1 Dno-Mir-489 Dre-Mir-489-v1 Eca-Mir-489 Gga-Mir-489-v1 Gja-Mir-489 Gmo-Mir-489-v1 Hsa-Mir-489-v1 Laf-Mir-489 Lch-Mir-489 Loc-Mir-489-v1 Mal-Mir-489-v1 Mml-Mir-489-v1 Mmr-Mir-489 Mmu-Mir-489 Ocu-Mir-489 Pab-Mir-489 Pbv-Mir-489 Rno-Mir-489 Sha-Mir-489 Spt-Mir-489 Tgu-Mir-489-v1 Tni-Mir-489-v1 Xla-Mir-489-P1-v1 Xla-Mir-489-P2-v1 Xtr-Mir-489-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_901765095.2_aMicUni1.2) |
LR594632.1: 133551959-133552020 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GACAUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCAGGAUCAUAUAUUGCGUGGUGGCUUGGUGGUCGUAUGUAUGACGUCAUUUACUUGGACUUGUAGGAGUGACAUCAUAUGUACGGCUGCUAAACUGCUACACGAGACAUCAUUUCUUCAGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 ACCAGGAUCAUAUAUUGC--| UG C UG C UACUUGG GUGG G UUGG GUCGUAUGUAUGA GUCAUU A CAUC C AAUC CGGCAUGUAUACU CAGUGA C GACUUCUUUACUACAGAGCA^ GU A GU A GGAUGUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mun-Mir-489_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGUCGUAUGUAUGACGUCAUU -22
Get sequence
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Mature sequence | Mun-Mir-489_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UGACAUCAUAUGUACGGCUGCU -62
Get sequence
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