MirGeneDB ID | Mmr-Mir-92-P1d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mmr-Mir-92-P1a Mmr-Mir-92-P1c Mmr-Mir-92-P2a Mmr-Mir-92-P2c Mmr-Mir-92-P2d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-92-P1d Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o1 Bla-Mir-92-o1 Bta-Mir-92-P1d Cel-Mir-92 Cfa-Mir-92-P1d Cja-Mir-92-P1d Cmi-Mir-92-P1d Cpi-Mir-92-P1d Cpo-Mir-92-P1d Dno-Mir-92-P1d Dre-Mir-92-P1d Eca-Mir-92-P1d Esc-Mir-92 Ete-Mir-92-P1d Gja-Mir-92-P1d Gsp-Mir-92 Hmi-Mir-92 Hsa-Mir-92-P1d Isc-Mir-92 Laf-Mir-92-P1d Lch-Mir-92-P1d Loc-Mir-92-P1d Mal-Mir-92-P1d Mdo-Mir-92-P1d Mml-Mir-92-P1d Mmu-Mir-92-P1d Mun-Mir-92-P1d Oan-Mir-92-P1d Obi-Mir-92 Ocu-Mir-92-P1d Pab-Mir-92-P1d Pbv-Mir-92-P1d Rno-Mir-92-P1d Sha-Mir-92-P1d Sme-Mir-92 Spt-Mir-92-P1d Sto-Mir-92-P1d Tgu-Mir-92-P1d Xla-Mir-92-P1d1 Xla-Mir-92-P1d2 Xtr-Mir-92-P1d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007662.1: 121445729-121445791 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAGUGGGAUCCCGGGCCCCGGGCGGGCGGGAGGGACGGGACGCGGUGCAGUGUUGUUCUUUCCCCCGCCAAUAUUGCACUCGUCCCGGCCUCCGGCCCCCCCGGCCCCCCGGCCUCCCCCUCAGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GAGUGGGAUCCCGGGCC--| C G GA C GUUCUUU CCGGG GGGC GGAGG CGGGACG GGUGCAGUGUU \ GGCCC CCCG CCUCC GCCCUGC UCACGUUAUAA C ACUCCCCCUCCGGCCCCCC^ C G G- - CCGCCCC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Mmr-Mir-92-P1d_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGGACGGGACGCGGUGCAGUGUU -24
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Mmr-Mir-92-P1d_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- UAUUGCACUCGUCCCGGCCUCC -63
Get sequence
|