MirGeneDB ID | Hsa-Let-7-P2a2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | LET-7 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAGGUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-let-7a-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Let-7-P1b Hsa-Let-7-P1c Hsa-Let-7-P1d Hsa-Let-7-P2a1 Hsa-Let-7-P2a3 Hsa-Let-7-P2b1 Hsa-Let-7-P2b2 Hsa-Let-7-P2b3 Hsa-Let-7-P2c1 Hsa-Let-7-P2c2 Hsa-Let-7-P2c3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Let-7 Aca-Let-7-P2a2 Ami-Let-7-P2a2 Bge-Let-7 Bpl-Let-7 Bta-Let-7-P2a2 Cfa-Let-7-P2a2 Cgi-Let-7 Cli-Let-7-P2a2 Cmi-Let-7-P2a2 Cpi-Let-7-P2a2 Cpo-Let-7-P2a2 Cte-Let-7 Dan-Let-7 Dma-Let-7 Dme-Let-7 Dmo-Let-7 Dno-Let-7-P2a2 Dpu-Let-7 Dre-Let-7-P2a2a Dre-Let-7-P2a2b Dsi-Let-7 Dya-Let-7 Esc-Let-7 Ete-Let-7-P2a2 Gga-Let-7-P2a2 Gja-Let-7-P2a2 Gmo-Let-7-P2a2a Hme-Let-7 Isc-Let-7 Lan-Let-7 Lch-Let-7-P2a2 Lgi-Let-7 Loc-Let-7-P2a2 Mal-Let-7-P2a2a Mal-Let-7-P2a2b Mdo-Let-7-P2a2 Mml-Let-7-P2a2 Mmu-Let-7-P2a2 Mun-Let-7-P2a2 Npo-Let-7 Oan-Let-7-P2a2 Obi-Let-7 Ocu-Let-7-P2a2 Ovu-Let-7 Pbv-Let-7-P2a2 Pfl-Let-7 Pmi-Let-7 Rno-Let-7-P2a2 Sha-Let-7-P2a2 Sko-Let-7 Spt-Let-7-P2a2 Spu-Let-7 Sto-Let-7-P2a2 Tca-Let-7 Tgu-Let-7-P2a2 Tni-Let-7-P2a2a Tni-Let-7-P2a2b Xbo-Let-7 Xla-Let-7-P2a2c Xla-Let-7-P2a2d Xtr-Let-7-P2a2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr22: 46112752-46112820 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Let-7-P2a2) |
Mir-3619
chr22: 46091059-46091112 [+]
UCSC
Ensembl
Let-7-P2a2 chr22: 46112752-46112820 [+] UCSC Ensembl Let-7-P2b2 chr22: 46113691-46113765 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUCGGCACCAAGACCGACUGCCCUUUGGGGUGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUUUGGGGCUCUGCCCUGCUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCUGAAGUGGCUGUAAUAUCUGCGGUGGACAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AUCGGCACCAAGACCGACU- -| UG U GU UGGGGCUCUGC GCC CUU GGG GAG AGUAGGUUGUAUAGUU C CGG GAA CCU UUC UCAUCUAACAUAUCAA C ACAGGUGGCGUCUAUAAUGU U^ GU - UG UAGGGUAUCGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Hsa-Let-7-P2a2_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0000062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000062 TargetScanVert: hsa-let-7a-5p TargetMiner: hsa-let-7a-5p miRDB: MIMAT0000062 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Hsa-Let-7-P2a2_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0004481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
48- CUAUACAAUCUACUGUCUUUC -69
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004481 TargetScanVert: hsa-let-7a-3p TargetMiner: hsa-let-7a-3p miRDB: MIMAT0004481 |