MirGeneDB ID | Hsa-Let-7-P2a3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | LET-7 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAGGUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-let-7f-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Let-7-P1b Hsa-Let-7-P1c Hsa-Let-7-P1d Hsa-Let-7-P2a1 Hsa-Let-7-P2a2 Hsa-Let-7-P2b1 Hsa-Let-7-P2b2 Hsa-Let-7-P2b3 Hsa-Let-7-P2c1 Hsa-Let-7-P2c2 Hsa-Let-7-P2c3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Let-7 Aca-Let-7-P2a3 Ami-Let-7-P2a3 Bge-Let-7 Bpl-Let-7 Bta-Let-7-P2a3 Cfa-Let-7-P2a3 Cgi-Let-7 Cpi-Let-7-P2a3 Cpo-Let-7-P2a3 Cte-Let-7 Dan-Let-7 Dma-Let-7 Dme-Let-7 Dmo-Let-7 Dno-Let-7-P2a3 Dpu-Let-7 Dre-Let-7-P2a3a Dre-Let-7-P2a3b Dsi-Let-7 Dya-Let-7 Esc-Let-7 Ete-Let-7-P2a3 Gja-Let-7-P2a3 Gmo-Let-7-P2a3a Gmo-Let-7-P2a3b Hme-Let-7 Isc-Let-7 Lan-Let-7 Lch-Let-7-P2a3 Lgi-Let-7 Loc-Let-7-P2a3 Mal-Let-7-P2a3a Mal-Let-7-P2a3b Mdo-Let-7-P2a3 Mml-Let-7-P2a3 Mmu-Let-7-P2a3 Mun-Let-7-P2a3 Npo-Let-7 Oan-Let-7-P2a3 Obi-Let-7 Ocu-Let-7-P2a3 Ovu-Let-7 Pbv-Let-7-P2a3 Pfl-Let-7 Pmi-Let-7 Rno-Let-7-P2a3 Sha-Let-7-P2a3 Sko-Let-7 Spt-Let-7-P2a3 Spu-Let-7 Sto-Let-7-P2a3 Tca-Let-7 Tgu-Let-7-P2a3 Tni-Let-7-P2a3a Tni-Let-7-P2a3b Xbo-Let-7 Xla-Let-7-P2a3d Xtr-Let-7-P2a3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chrX: 53557197-53557267 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Let-7-P2a3) |
Let-7-P2b3
chrX: 53556242-53556320 [-]
UCSC
Ensembl
Let-7-P2a3 chrX: 53557197-53557267 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCUGAAGAUGGACACUGGUGCUCUGUGGGAUGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUUUUAGGGUCAUACCCCAUCUUGGAGAUAACUAUACAGUCUACUGUCUUUCCCACGGUGGUACACUUCUUCUCCGACUGGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCUGAAGAUGGACACUG- -| U GU UUAGGGUCAUAC GUGCU CUGUGGGA GAG AGUAGAUUGUAUAGUU C CAUGG GGCACCCU UUC UCAUCUGACAUAUCAA C CGGUCAGCCUCUUCUUCA U^ - UG UAGAGGUUCUAC . 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Let-7-P2a3_5p |
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mirBase accession | MIMAT0000067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000067 TargetScanVert: hsa-let-7f-5p TargetMiner: hsa-let-7f-5p miRDB: MIMAT0000067 |
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Star sequence | Hsa-Let-7-P2a3_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004487 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
50- CUAUACAGUCUACUGUCUUUC -71
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004487 TargetScanVert: hsa-let-7f-2-3p TargetMiner: hsa-let-7f-2-3p miRDB: MIMAT0004487 |