| MirGeneDB ID | Mml-Mir-15-P2d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-15 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-195 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-15-P1a Mml-Mir-15-P1b Mml-Mir-15-P1c Mml-Mir-15-P1d Mml-Mir-15-P2a Mml-Mir-15-P2b Mml-Mir-15-P2c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-15-P2d Ami-Mir-15-P2d Bta-Mir-15-P2d Cfa-Mir-15-P2d Cin-Mir-15-P2 Cja-Mir-15-P2d Cpo-Mir-15-P2d Dno-Mir-15-P2d Dre-Mir-15-P2d Eca-Mir-15-P2d Ete-Mir-15-P2d Gja-Mir-15-P2d Hsa-Mir-15-P2d Laf-Mir-15-P2d Loc-Mir-15-P2d Mal-Mir-15-P2d Mdo-Mir-15-P2d Mmr-Mir-15-P2d Mmu-Mir-15-P2d Neu-Mir-15-P2d Oan-Mir-15-P2d Ocu-Mir-15-P2d Pab-Mir-15-P2d Rno-Mir-15-P2d Sha-Mir-15-P2d Sto-Mir-15-P2d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Olfactores | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014351.1: 6775472-6775532 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-15-P2d) |
Mir-15-P2d
CM014351.1: 6775472-6775532 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-15-P1d CM014351.1: 6775784-6775845 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | AGCAGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUGUUACCCACACCCAGCUUCCCUGGCUCUAGCAGCACAGAAAUAUUGGCACAGGGAAGCAAGUCUGCCAAUAUUGGCUGUGCUGCUCCAGGCAGGGUGGUGAAAACUACCGAGGAGGGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUUGUUACCCACACCCA-- U G CU A-| CAGGGA GCU CCCUG CU AGCAGCACAG AAUAUUGGCA A UGG GGGAC GA UCGUCGUGUC UUAUAACCGU G GGGGAGGAGCCAUCAAAAG U G CC GG^ CUGAAC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-15-P2d_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006228 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAGCAGCACAGAAAUAUUGGCA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-195-5p |
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| Star sequence | Mml-Mir-15-P2d_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0026838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CCAAUAUUGGCUGUGCUGCUCCA -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-195-3p |
