| MirGeneDB ID | Hsa-Mir-219-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-219 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGUUGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hsa-mir-219a-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Hsa-Mir-219-P2 Hsa-Mir-219-P2-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-219 Aca-Mir-219-P3 Ami-Mir-219-P3 Bfl-Mir-219 Bge-Mir-219 Bla-Mir-219 Bta-Mir-219-P3 Cfa-Mir-219-P3 Cgi-Mir-219 Cin-Mir-219 Cmi-Mir-219-P3 Cpi-Mir-219-P3 Cpo-Mir-219-P3 Csc-Mir-219 Cte-Mir-219 Dan-Mir-219 Dma-Mir-219 Dme-Mir-219 Dmo-Mir-219 Dno-Mir-219-P3 Dpu-Mir-219 Dre-Mir-219-P3a Dsi-Mir-219 Dya-Mir-219 Esc-Mir-219 Ete-Mir-219-P3 Gja-Mir-219-P3 Gmo-Mir-219-P3a Gmo-Mir-219-P3b Isc-Mir-219 Lan-Mir-219 Lch-Mir-219-P3 Mal-Mir-219-P3a Mal-Mir-219-P3b Mdo-Mir-219-P3 Mml-Mir-219-P3 Mmu-Mir-219-P3 Mmu-Mir-219-P3-as Mun-Mir-219-P3-v1 Mun-Mir-219-P3-v2 Obi-Mir-219 Ocu-Mir-219-P3 Ovu-Mir-219 Pbv-Mir-219-P3 Pfl-Mir-219 Pmi-Mir-219 Rno-Mir-219-P3 Sha-Mir-219-P3 Sko-Mir-219 Spt-Mir-219-P3 Spu-Mir-219 Sto-Mir-219-P3-v1 Sto-Mir-219-P3-v2 Tca-Mir-219 Tni-Mir-219-P3a Tni-Mir-219-P3b Xbo-Mir-219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (hg38) |
chr6: 33207855-33207917 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCUCCCUUCCCCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAUGGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGGGAGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CCUCCCUUCCCCGCCCC--| C CU U A G AGUCUAU GGGC GCGGCUC GAU GUCCA AC CAAUUCUCG G CCCG CGCCGAG CUG CAGGU UG GUUGAGAGC G AGAGGGCGAGCUCCAAACC^ C CC - C A CGGCCUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hsa-Mir-219-P3_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0000276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCG -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000276 TargetScanVert: hsa-miR-219a-5p miRDB: MIMAT0000276 |
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| Mature sequence | Hsa-Mir-219-P3_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0004567 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- AGAGUUGAGUCUGGACGUCCCG -63
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004567 TargetScanVert: hsa-miR-219a-1-3p miRDB: MIMAT0004567 |
