| MirGeneDB ID | Hme-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hme-mir-307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Hme-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dpu-Mir-67 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pdu-Mir-67 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tur-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Hmel_1) |
HE671244: 79056-79123 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v2) |
Mir-67-v1
HE671244: 79056-79123 [-]
Ensembl
Mir-67-v2 HE671244: 79056-79123 [-] Ensembl |
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| Variant | Hme-Mir-67-v2 |
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| Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGAAGAAAUGUGAAAUGCUCAUUUCCGGCUACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUGUGCACUCGUUGCUCGGCCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGACCGUGGGUGGGACAUCUACAUUAAAAAAUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AGAAGAAAUGUGAAAUG--| UC CUA CCU G GUGUGCACUC CUCAUU CGG CUCACUCAA GG UGUGAU G GGGUGG GCC GAGUGAGUU CC ACACUA U AUAAAAAAUUACAUCUACA^ GU AGC CCU A CCCGGCUCGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hme-Mir-67-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Hme-Mir-67-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0024976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
46- CACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -68
Get sequence
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| Variant | Hme-Mir-67-v1 |
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| Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGAAGAAAUGUGAAAUGCUCAUUUCCGGCUACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUGUGCACUCGUUGCUCGGCCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGACCGUGGGUGGGACAUCUACAUUAAAAAAUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AGAAGAAAUGUGAAAUG--| UC CUA CCU G UGUGCACUC CUCAUU CGG CUCACUCAA GG UGUGAUG G GGGUGG GCC GAGUGAGUU CC ACACUAC U AUAAAAAAUUACAUCUACA^ GU AGC CCU A CCGGCUCGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hme-Mir-67-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Hme-Mir-67-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0024976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
45- UCACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -68
Get sequence
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