MirGeneDB ID | Bta-Mir-181-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-181 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACAUUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | bta-mir-181b-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bta-Mir-181-P1a Bta-Mir-181-P1b Bta-Mir-181-P1c Bta-Mir-181-P2a Bta-Mir-181-P2c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-181-P2b Ami-Mir-181-P2b Cfa-Mir-181-P2b Cli-Mir-181-P2b Cpi-Mir-181-P2b Cpo-Mir-181-P2b Dno-Mir-181-P2b Dre-Mir-181-P2b1 Dre-Mir-181-P2b2 Ete-Mir-181-P2b Gga-Mir-181-P2b Hsa-Mir-181-P2b Mdo-Mir-181-P2b Mml-Mir-181-P2b Mmu-Mir-181-P2b Oan-Mir-181-P2b Ocu-Mir-181-P2b Rno-Mir-181-P2b Sha-Mir-181-P2b Sto-Mir-181-P2b Tgu-Mir-181-P2b Xtr-Mir-181-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (bosTau8) |
chr11: 95710641-95710700 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered MiRNAs (< 10kb from Mir-181-P2b) |
Mir-181-P1b
chr11: 95709449-95709508 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-181-P2b chr11: 95710641-95710700 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CACCAACUGAAAACACUGAUGGCUGCACUCAACAUUCAUUGCUGUCGGUGGGUUUGACUUUGAAUCAACUCACUGAUCAAUGAAUGUAAACUGCGGACCAAACAACCCAAGGGAAGCAAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CACCAACUGAAAACACUGA- -| CUCA CU UGACU UGG CUGCA ACAUUCAUUG GUCGGUGGGUU U ACC GGCGU UGUAAGUAAC UAGUCACUCAA U AAACGAAGGGAACCCAACAA A^ CAAA -- CUAAG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Bta-Mir-181-P2b_5p |
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MirBase accession | MIMAT0003793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGGUU -24
Get sequence
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Validated targets |
TargetScanVert: bta-miR-181b |
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Star sequence | Bta-Mir-181-P2b_3p* |
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MirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- CUCACUGAUCAAUGAAUGUAAA -60
Get sequence
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