Mir
Gene
DB
2.1
Home
Browse
Search
Download
Information
81 microRNA genes with seed UACAGUA
Sort by genome coordinates
Motifs
MirGeneDB ID
MiRBase ID
Family
Seed
5p accession
3p accession
Chromosome
Start
End
Strand
Node of origin (locus)
Node of origin (family)
3' NTU
UG
▼
UGUG
CNNC
Pbv-Mir-144
pbv-mir-144
MIR-144
UACAGUA
MIMAT0038957
MIMAT0038958
KE957536.1
98855
98911
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Xla-Mir-144-P1-v1
None
MIR-144
GAUAUCA
None
None
NC_030726.1
32856364
32856421
+
X. laevis
Vertebrata
No
1
1
Xla-Mir-144-P2-v1
xla-mir-144
MIR-144
GAUAUCA
MIMAT0046458
MIMAT0046459
NC_030727.1
4344085
4344142
-
X. laevis
Vertebrata
No
1
1
Hsa-Mir-144-v2
hsa-mir-144
MIR-144
UACAGUA
MIMAT0004600
MIMAT0000436
chr17
28861547
28861604
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Sto-Mir-101-P1-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
BFAA01000061.1
1365252
1365308
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Cmi-Mir-101-P1-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
KI635887.1
6427948
6428004
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Spt-Mir-144
None
MIR-144
GAUAUCA
None
None
QEPC01008384.1
2358679
2358736
+
Vertebrata
Vertebrata
Unknown
1
Ete-Mir-144
None
MIR-144
GAUAUCA
None
None
JH980319
4842438
4842495
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Lch-Mir-144
None
MIR-144
UACAGUA
None
None
JH127350.1
728206
728264
-
Vertebrata
Vertebrata
Unknown
Tgu-Mir-144-v2
tgu-mir-144
MIR-144
GAUAUCA
MIMAT0014650
MIMAT0014596
19
4217046
4217103
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Ebu-Mir-144-v2
None
MIR-144
UACAGUA
None
None
FYBX02009908.1
8547203
8547259
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Aca-Mir-144-v2
aca-mir-144
MIR-144
GAUAUCA
MIMAT0021771
MIMAT0021772
G889P68288RO14
342
398
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Gja-Mir-144-v2
None
MIR-144
UACAGUA
None
None
NW_015173122.1
2276609
2276665
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Mun-Mir-144-v2
None
MIR-144
GAUAUCA
None
None
144-v1_LR594644.1:58948985-58949242
101
158
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Gmo-Mir-144-v2
gmo-mir-144
MIR-144
UACAGUA
MIMAT0044027
MIMAT0044028
contig314418
343
401
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Mal-Mir-144-v2
None
MIR-144
GAUAUCA
None
None
KV884735.1
275834
275892
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Dre-Mir-144-v2
dre-mir-144
MIR-144
UACAGUA
MIMAT0031975
MIMAT0001841
chr5
42272092
42272150
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Cli-Mir-144-v2
None
MIR-144
GAUAUCA
None
None
SRR516967
48
105
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Loc-Mir-144-v2
None
MIR-144
UACAGUA
None
None
LG22
3766309
3766367
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Tgu-Mir-101-P1-v2
tgu-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0014631
MIMAT0014508
8
1553621
1553677
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Hsa-Mir-101-P1-v2
hsa-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0004513
MIMAT0000099
chr1
65058442
65058498
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Ami-Mir-101-P1-v2
ami-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0038116
MIMAT0038117
NW_017710321.1
12121220
12121276
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Mml-Mir-101-P1-v2
mml-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0026581
MIMAT0002431
chr1
64744977
64745033
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Cpi-Mir-101-P1-v2
cpi-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0037716
MIMAT0037717
JH584706
839803
839859
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Mmu-Mir-101-P1-v2
mmu-mir-101a
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0004526
MIMAT0000133
chr4
101346957
101347013
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Aca-Mir-101-P1-v2
aca-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0021710
MIMAT0021711
4
98411455
98411511
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Rno-Mir-101-P1-v2
rno-mir-101a
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0004726
MIMAT0000823
chr5
120168445
120168501
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Pbv-Mir-101-P1-v2
pbv-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0038901
MIMAT0038902
KE954279.1
114045
114101
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Cpo-Mir-101-P1-v2
cpo-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0046947
MIMAT0046948
scaffold_2
67531173
67531229
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Gja-Mir-101-P1-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
NW_015177048.1
96035
96091
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Ocu-Mir-101-P1-v2
ocu-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0048186
MIMAT0048187
chr13
101340539
101340595
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Cfa-Mir-101-P1-v2
cfa-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0006600
chr5
45184773
45184829
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Bta-Mir-101-P1-v2
bta-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0003520
NC_037330.1
80335450
80335506
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Xtr-Mir-101-P1-v2
xtr-mir-101a-2
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0003662
chr4
79102564
79102620
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Dno-Mir-101-P1-v2
dno-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0047598
MIMAT0047599
JH582969
1484136
1484192
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Mun-Mir-101-P1-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
101-P1-v1_LR594637.1:42114281-42114423
44
100
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Ete-Mir-101-P1-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
JH980298
60204640
60204696
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Sha-Mir-101-P1-v2
sha-mir-101
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0022811
GL856736.1
1265482
1265538
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Tni-Mir-101-P1-v2
tni-mir-101a
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0002903
1
20355622
20355678
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Mdo-Mir-101-P1-v2
mdo-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0031076
MIMAT0004098
2
26267876
26267932
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Gmo-Mir-101-P1-v2
gmo-mir-101a
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0044119
MIMAT0044120
GeneScaffold_1472
99850
99906
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Oan-Mir-101-P1-v2
oan-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0007011
NC_041745.1
41083107
41083163
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Mal-Mir-101-P1-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
KV884746.1
1742490
1742546
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Gga-Mir-101-P1-v2
gga-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0031077
MIMAT0001185
8
28612657
28612713
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Dre-Mir-101-P1-v2
dre-mir-101a
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0001814
chr6
31365459
31365515
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Cli-Mir-101-P1-v2
cli-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0038482
MIMAT0038483
scaffold7
15720709
15720765
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Loc-Mir-101-P1-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
LG10
10266779
10266835
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Tgu-Mir-101-P2-v2
tgu-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0031101
MIMAT0014508
Z
68899073
68899129
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Sto-Mir-101-P2-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
BFAA01004869.1
93867
93923
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Hsa-Mir-101-P2-v2
hsa-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0037312
MIMAT0000099
chr9
4850309
4850365
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Ami-Mir-101-P2-v2
ami-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0038118
MIMAT0038117
NW_017713772.1
32263712
32263768
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Cmi-Mir-101-P2-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
KI635975.1
375731
375786
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Mml-Mir-101-P2-v2
mml-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0031100
MIMAT0002431
chr15
79649348
79649404
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Cpi-Mir-101-P2-v2
cpi-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0037718
MIMAT0037717
JH584680
13719007
13719063
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Mmu-Mir-101-P2-v2
mmu-mir-101b
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0017046
MIMAT0000616
chr19
29135303
29135359
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Aca-Mir-101-P2-v2
aca-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0021712
MIMAT0021711
2
52137658
52137714
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Rno-Mir-101-P2-v2
rno-mir-101b
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0017045
MIMAT0000615
chr1
247263747
247263803
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Pbv-Mir-101-P2-v2
pbv-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0038903
MIMAT0038902
KE954797.1
126582
126638
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Cpo-Mir-101-P2-v2
cpo-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0046949
MIMAT0046948
scaffold_21
15000496
15000552
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Gja-Mir-101-P2-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
NW_015163623.1
608903
608959
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Ocu-Mir-101-P2-v2
ocu-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0048188
MIMAT0048187
chr1
49384672
49384728
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Cfa-Mir-101-P2-v2
cfa-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0006600
chr1
93194327
93194383
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Bta-Mir-101-P2-v2
bta-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0003520
NC_037335.1
39689039
39689095
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Xtr-Mir-101-P2-v2
xtr-mir-101a-1
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0003662
chr1
115031352
115031408
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Dno-Mir-101-P2-v2
dno-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0047600
MIMAT0047599
JH567481
2307392
2307448
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Mun-Mir-101-P2-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
101-P2-v1_LR594633.1:234314504-234314646
44
100
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Ete-Mir-101-P2-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
JH980382
6713737
6713793
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Sha-Mir-101-P2-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
GL841562.1
1424391
1424447
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Tni-Mir-101-P2-v2
tni-mir-101b
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0003040
4
1028861
1028917
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Mdo-Mir-101-P2-v2
mdo-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0026657
MIMAT0004098
6
166669178
166669234
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Gmo-Mir-101-P2-v2
gmo-mir-101b
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0044231
MIMAT0044232
GeneScaffold_3576
29660
29716
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Oan-Mir-101-P2-v2
oan-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0007011
NC_041753.1
52495167
52495223
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Mal-Mir-101-P2-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
KV884763.1
1469812
1469868
+
Vertebrata
Vertebrata
No
1
Gga-Mir-101-P2-v2
gga-mir-101-1
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0026545
MIMAT0001185
Z
27510599
27510655
+
Vertebrata
Vertebrata
No
Dre-Mir-101-P2-v2
dre-mir-101b
MIR-101
UACAGUA
None
MIMAT0001815
chr5
1837177
1837233
-
Vertebrata
Vertebrata
No
1
1
Cli-Mir-101-P2-v2
cli-mir-101-2
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0038484
MIMAT0038483
scaffold6
3523035
3523091
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Loc-Mir-101-P2-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
LG2
37364266
37364322
-
Vertebrata
Vertebrata
No
Xla-Mir-101-P1a-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
NC_030730.1
73858578
73858634
+
X. laevis
Vertebrata
No
Xla-Mir-101-P2a-v2
xla-mir-101
MIR-101
UACAGUA
MIMAT0046412
MIMAT0046413
NC_030724.1
125355860
125355916
-
X. laevis
Vertebrata
No
Xla-Mir-101-P1b-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
NC_030731.1
58882294
58882350
+
X. laevis
Vertebrata
No
Xla-Mir-101-P2b-v2
None
MIR-101
UACAGUA
None
None
NW_016694889.1
314987
315043
-
X. laevis
Vertebrata
No
1
Download sequences for:
precursor
|
5p
|
3p
|
mature
|
star
|
mature/star
|
loop
|
extend_pre
|
all