| MirGeneDB ID | Aga-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | aga-mir-307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Aga-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dpu-Mir-67 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pdu-Mir-67 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tur-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064602.1: 91904833-91904891 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v2) |
Mir-67-v1
NC_064602.1: 91904833-91904891 [+]
Ensembl
Mir-67-v2 NC_064602.1: 91904833-91904891 [+] Ensembl |
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| Variant | Aga-Mir-67-v2 |
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| Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUCUCUCUCUCUGGACUCAUUCUCUCGAUCACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGCUUUUUUGAAUCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGACCGCGGAUUGACUAAAACCACACAUACGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUCUCUCUCUCUGGACU---| U U U A A CCU G GCUUUU CA UC C CG UC CUCACUCAA GG UGUGAU \ GU AG G GC AG GAGUGAGUU CC ACACUA U ACGCAUACACACCAAAAUCA^ U - C C C CCU A CUAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Aga-Mir-67-v2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Aga-Mir-67-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0001519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -59
Get sequence
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| Variant | Aga-Mir-67-v1 |
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| Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUCUCUCUCUCUGGACUCAUUCUCUCGAUCACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGCUUUUUUGAAUCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGACCGCGGAUUGACUAAAACCACACAUACGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUCUCUCUCUCUGGACU---| U U U A A CCU G CUUUU CA UC C CG UC CUCACUCAA GG UGUGAUG \ GU AG G GC AG GAGUGAGUU CC ACACUAC U ACGCAUACACACCAAAAUCA^ U - C C C CCU A UAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Aga-Mir-67-v1_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Aga-Mir-67-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0001519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UCACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -59
Get sequence
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