MirGeneDB ID | Oan-Mir-192-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-192 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGACCUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | oan-mir-192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Oan-Mir-192-P1 Oan-Mir-192-P1-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-192-P2 Bta-Mir-192-P2 Cfa-Mir-192-P2 Cpi-Mir-192-P2 Cpo-Mir-192-P2 Dno-Mir-192-P2 Dre-Mir-192-P2b Ete-Mir-192-P2 Gja-Mir-192-P2 Gmo-Mir-192-P2b Hsa-Mir-192-P2 Loc-Mir-192-P2 Mal-Mir-192-P2b Mml-Mir-192-P2 Mmu-Mir-192-P2 Mun-Mir-192-P2 Ocu-Mir-192-P2 Rno-Mir-192-P2 Sha-Mir-192-P2 Spt-Mir-192-P2 Tni-Mir-192-P2b-v1 Tni-Mir-192-P2b-v2 Xla-Mir-192-P2c Xla-Mir-192-P2d Xtr-Mir-192-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041730.1: 7220148-7220211 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-192-P2) |
Mir-194-P2
NC_041730.1: 7219904-7219961 [+]
Mir-192-P2 NC_041730.1: 7220148-7220211 [+] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCCCUCGGAGAGAGAGAGCGCACAGGGCUCUGACCUAUGAAUUGACAGCCAGUUCUCUCUGACCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCUCAAAGCCAGCAGCGAGGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCCCCUCGGAGAGAGAGA-- C GG C- -| A AGUUCUCUC GCG ACA GCU UGACCUAU GAAUUG CAGCC \ CGC UGU UGG ACUGGAUA CUUAAC GUCGG U AGGAGCGACGACCGAAACUC U A- AC C^ C UCUCCCCAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Oan-Mir-192-P2_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0007016 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGACCUAUGAAUUGACAGCC -21
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Oan-Mir-192-P2_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0007017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- CUGCCAAUUCCAUAGGUCACAG -64
Get sequence
|