MirGeneDB ID | Cpo-Mir-192-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-192 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGACCUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cpo-mir-192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Cpo-Mir-192-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-192-P2 Bta-Mir-192-P2 Cfa-Mir-192-P2 Cpi-Mir-192-P2 Dno-Mir-192-P2 Dre-Mir-192-P2b Ete-Mir-192-P2 Gja-Mir-192-P2 Gmo-Mir-192-P2b Hsa-Mir-192-P2 Loc-Mir-192-P2 Mal-Mir-192-P2b Mml-Mir-192-P2 Mmu-Mir-192-P2 Mun-Mir-192-P2 Oan-Mir-192-P2 Ocu-Mir-192-P2 Rno-Mir-192-P2 Sha-Mir-192-P2 Spt-Mir-192-P2 Tni-Mir-192-P2b-v1 Tni-Mir-192-P2b-v2 Xla-Mir-192-P2c Xla-Mir-192-P2d Xtr-Mir-192-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (cavPor3) |
scaffold_42: 5717225-5717289 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-192-P2) |
Mir-192-P2
scaffold_42: 5717225-5717289 [-]
UCSC
Mir-194-P2 scaffold_42: 5717423-5717480 [-] UCSC |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGGCUGCCCAAGACCGAGUGCACAGGGCUCUGACCUAUGAAUUGACAGCCAGUGCUGUCAGCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCUCAAUGCCUGCCGCCGCUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGGCUGCCCAAGACCGA-- C GG C- -| A AGUGCUGUC GUG ACA GCU UGACCUAU GAAUUG CAGCC A CGC UGU UGG ACUGGAUA CUUAAC GUCGG G GUCGCCGCCGUCCGUAACUC U A- AC C^ C UCUCCCCUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cpo-Mir-192-P2_5p |
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mirBase accession | MIMAT0047068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGACCUAUGAAUUGACAGCC -21
Get sequence
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Star sequence | Cpo-Mir-192-P2_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0047069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- CUGCCAAUUCCAUAGGUCACAG -65
Get sequence
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