| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-204-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-204 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-204-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-204-P1 Ami-Mir-204-P1 Bta-Mir-204-P1 Cfa-Mir-204-P1 Cja-Mir-204-P1 Cli-Mir-204-P1 Cmi-Mir-204-P1 Cpi-Mir-204-P1 Cpo-Mir-204-P1 Dno-Mir-204-P1 Dre-Mir-204-P1a Dre-Mir-204-P1b Ebu-Mir-204 Eca-Mir-204-P1 Gga-Mir-204-P1 Gja-Mir-204-P1 Gmo-Mir-204-P1a Gmo-Mir-204-P1b Hsa-Mir-204-P1 Laf-Mir-204-P1 Lch-Mir-204-P1 Loc-Mir-204-P1 Mal-Mir-204-P1a Mdo-Mir-204-P1 Mml-Mir-204-P1 Mmr-Mir-204-P1 Mun-Mir-204-P1 Neu-Mir-204-P1 Oan-Mir-204-P1 Ocu-Mir-204-P1 Pab-Mir-204-P1 Pbv-Mir-204-P1 Pma-Mir-204 Rno-Mir-204-P1 Sha-Mir-204-P1 Spt-Mir-204-P1 Sto-Mir-204-P1 Tgu-Mir-204-P1 Tni-Mir-204-P1a Xla-Mir-204-P1c Xla-Mir-204-P1d Xtr-Mir-204-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 64205831-64205888 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCCCUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAUUCUGCUUGGACCUGUGACCUGUGGGCUUCCCUUUGUCAUCCUUUGCCUAGGCCUCUGAGUGAGGCAAGGACAGCAAAGGGGGGCUCAGUGGUCACCUCUACUGCAGAGAGUUCAGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AAAUUCUGCUUGGACCU--| UG CA U AGGCCU GUGACC UGGGCUUCCCUUUGU UCCUU GCCU \ CACUGG ACUCGGGGGGAAACG AGGAA CGGA C ACUUGAGAGACGUCAUCUC^ UG AC - GUGAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Mmu-Mir-204-P1_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0000668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCCCUUUGUCAUCCUUUGCCU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000668 TargetScanVert: mmu-miR-211-5p miRDB: MIMAT0000668 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Mmu-Mir-204-P1_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0017059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GCAAGGACAGCAAAGGGGGGC -58
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-211-3p miRDB: MIMAT0017059 |
