| MirGeneDB ID | Mal-Mir-460-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-460 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Asian swamp eel (Monopterus albus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mal-Mir-460-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-460-P1 Ami-Mir-460-P1 Cli-Mir-460-P1 Cpi-Mir-460-P1 Dre-Mir-460-P1 Gga-Mir-460-P1 Gja-Mir-460-P1 Gmo-Mir-460-P1 Lch-Mir-460-P1 Loc-Mir-460-P1 Mdo-Mir-460-P1 Mun-Mir-460-P1 Neu-Mir-460-P1 Oan-Mir-460-P1 Sha-Mir-460-P1 Spt-Mir-460-P1 Tgu-Mir-460-P1 Tni-Mir-460-P1 Xla-Mir-460-P1a Xla-Mir-460-P1b Xtr-Mir-460-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_001952655.1_M_albus_1.0_genomic) |
KV884702.1: 4251764-4251822 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGCAUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AACACAUGCAUGAAUAUGGGUUUUACAGUUCCUGCAUUGUACACACUGUGCAUUUAACUUAUGUAAGCACAGCGCAUACAAUGUGGAUACUGUGUUACCCAGAUUCUACCCAUAUGAGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AACACAUGCAUGAAUAU--| UU UC UG CACA AUUUAAC GGGU UACAGU C CAUUGUA CUGUGC \ CCCA GUGUCA G GUAACAU GACACG U CGAGUAUACCCAUCUUAGA^ UU UA GU ACGC AAUGUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mal-Mir-460-P1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUGCAUUGUACACACUGUGCA -22
Get sequence
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| Star sequence | Mal-Mir-460-P1_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACAGCGCAUACAAUGUGGAUA -59
Get sequence
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