MirGeneDB ID | Hsa-Mir-430-P38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAAGCGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-518a-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-430-P1 Hsa-Mir-430-P2 Hsa-Mir-430-P3 Hsa-Mir-430-P4 Hsa-Mir-430-P5 Hsa-Mir-430-P6 Hsa-Mir-430-P7 Hsa-Mir-430-P8a Hsa-Mir-430-P8b Hsa-Mir-430-P9a Hsa-Mir-430-P9b Hsa-Mir-430-P10 Hsa-Mir-430-P11 Hsa-Mir-430-P12 Hsa-Mir-430-P13 Hsa-Mir-430-P14 Hsa-Mir-430-P15 Hsa-Mir-430-P16 Hsa-Mir-430-P17 Hsa-Mir-430-P18 Hsa-Mir-430-P19 Hsa-Mir-430-P20 Hsa-Mir-430-P21 Hsa-Mir-430-P22 Hsa-Mir-430-P23 Hsa-Mir-430-P24 Hsa-Mir-430-P25 Hsa-Mir-430-P26 Hsa-Mir-430-P27a Hsa-Mir-430-P27b Hsa-Mir-430-P29a Hsa-Mir-430-P29b Hsa-Mir-430-P31a Hsa-Mir-430-P31b Hsa-Mir-430-P33 Hsa-Mir-430-P34 Hsa-Mir-430-P35a Hsa-Mir-430-P35b Hsa-Mir-430-P35c Hsa-Mir-430-P39 Hsa-Mir-430-P41 Hsa-Mir-430-P42 Hsa-Mir-430-P43 Hsa-Mir-430-P44 Hsa-Mir-430-P45 Hsa-Mir-430-P46 Hsa-Mir-430-P47 Hsa-Mir-430-P48 Hsa-Mir-430-P49 Hsa-Mir-430-P50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Pbv-Mir-430-o38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | H. sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr19: 53731019-53731078 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P38) |
Mir-430-P26
chr19: 53682173-53682233 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P9a chr19: 53685022-53685080 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P18 chr19: 53686484-53686543 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P49 chr19: 53688495-53688553 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P21 chr19: 53690895-53690953 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P47 chr19: 53694406-53694464 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P17 chr19: 53695225-53695284 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P44 chr19: 53697547-53697605 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P42 chr19: 53698400-53698458 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P14 chr19: 53700030-53700088 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P22 chr19: 53701228-53701288 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P10 chr19: 53702750-53702808 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P45 chr19: 53706266-53706324 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P23 chr19: 53707468-53707527 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P11 chr19: 53708759-53708817 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P43 chr19: 53711017-53711075 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35a chr19: 53712282-53712342 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P19 chr19: 53713361-53713422 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29b chr19: 53716608-53716668 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24 chr19: 53720111-53720170 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35b chr19: 53721081-53721139 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P27b chr19: 53722182-53722241 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P34 chr19: 53725457-53725514 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P46 chr19: 53726928-53726982 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P13 chr19: 53729853-53729911 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P38 chr19: 53731019-53731078 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P12 chr19: 53734892-53734950 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P33 chr19: 53736860-53736922 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P39 chr19: 53739348-53739407 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35c chr19: 53741332-53741390 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P27a chr19: 53742528-53742587 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29a chr19: 53748650-53748710 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P41 chr19: 53751226-53751285 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P15 chr19: 53752410-53752470 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P48 chr19: 53754031-53754089 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31a chr19: 53756756-53756818 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P50 chr19: 53758246-53758304 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31b chr19: 53761148-53761210 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P16 chr19: 53762358-53762418 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUGCCGGAGCAAGAAGAUCUCAAGCUGUGACUGCAAAGGGAAGCCCUUUCUGUUGUCUGAAAGAAGAGAAAGCGCUUCCCUUUGCUGGAUUACGGUUUGAGAAAAACAACACUGAAGCUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GUGCCGGAGCAAGAAGA- - -| C GUUGUCU UCUCAAGCUGUGA CU GCAAAGGGAAGC CUUUCU \ AGAGUUUGGCAUU GG CGUUUCCCUUCG GAAAGA G GUCGAAGUCACAACAAAA A U^ C GAAGAAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Hsa-Mir-430-P38_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0005457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGCAAAGGGAAGCCCUUUCUG -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005457 TargetScanVert: hsa-miR-518a-5p TargetMiner: hsa-miR-518a-5p miRDB: MIMAT0005457 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Hsa-Mir-430-P38_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0002863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- GAAAGCGCUUCCCUUUGCUGGAU -60
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0002863 TargetScanVert: hsa-miR-518a-3p TargetMiner: hsa-miR-518a-3p miRDB: MIMAT0002863 |