MirGeneDB ID | Dno-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-459 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-459 Bta-Mir-459 Cfa-Mir-459 Cja-Mir-459 Cli-Mir-459 Cpi-Mir-459 Cpo-Mir-459 Dre-Mir-459 Ebu-Mir-459 Eca-Mir-459 Ete-Mir-459 Gmo-Mir-459 Hsa-Mir-459 Laf-Mir-459 Loc-Mir-459 Mal-Mir-459 Mml-Mir-459 Mmr-Mir-459 Mmu-Mir-459 Mun-Mir-459 Oan-Mir-459 Ocu-Mir-459 Pab-Mir-459 Pma-Mir-459 Rno-Mir-459 Spt-Mir-459 Sto-Mir-459 Tni-Mir-459 Xla-Mir-459-P1 Xla-Mir-459-P2 Xtr-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH573390: 2215448-2215508 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAGUAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCUUGCCACCAGACUUCUAUUAUUUGCAUUCAGUAACAAAGUUUCAUCCUUGUGUCCAUCAAGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUGGUGUAAUUAAUAGCUGCACCUCGCAUGGAGUGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCUUGCCACCAGACUU--| U UC A U A GUCCA CUAUUA UUGCAU AGU ACAAAG UUC UCCUUGU U GAUAAU AAUGUG UCA UGUUUC AAG AGGAACA C GUGAGGUACGCUCCACGUC^ U GU C U - ACGAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dno-Mir-459_5p |
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mirBase accession | MIMAT0048014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAGUAACAAAGUUUCAUCCUUGU -24
Get sequence
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Co-mature sequence | Dno-Mir-459_3p |
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mirBase accession | MIMAT0048015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AAGGAGAAUCUUUGUCACUUGGU -61
Get sequence
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