| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-459 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGUAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-459 Bta-Mir-459 Cli-Mir-459 Cpi-Mir-459 Cpo-Mir-459 Dno-Mir-459 Dre-Mir-459 Ebu-Mir-459 Ete-Mir-459 Gmo-Mir-459 Hsa-Mir-459 Loc-Mir-459 Mal-Mir-459 Mml-Mir-459 Mmu-Mir-459 Mun-Mir-459 Oan-Mir-459 Ocu-Mir-459 Pma-Mir-459 Rno-Mir-459 Spt-Mir-459 Sto-Mir-459 Tni-Mir-459 Xla-Mir-459-P1 Xla-Mir-459-P2 Xtr-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr31: 31005215-31005275 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGAUCCGCACCAGACUUCUAUUAUUUGUACUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCGUCAAGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGUACCUCGCAUGGGAAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGAUCCGCACCAGACUU--| U C A A GUCCG CUAUUA UUGUACU AGU ACAAAGAUUC UCCUUGU U GAUAAU AAUGUGA UCA UGUUUCUAAG AGGAACA C GAAGGGUACGCUCCAUGUC^ U U C - ACGAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-459_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGU -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-802 miRDB: MIMAT0009928 |
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| Star sequence | Cfa-Mir-459_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGU -61
Get sequence
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