| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-9-P9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-9 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dlo-Mir-9-P10 Dlo-Mir-9-P12-v1 Dlo-Mir-9-P13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-9 Bfl-Mir-9 Bko-Mir-9 Bla-Mir-9 Bpl-Mir-9 Cin-Mir-9 Cte-Mir-9 Dan-Mir-9-P9 Dgr-Mir-9 Dma-Mir-9-P9 Dme-Mir-9-P9 Dmo-Mir-9-P9 Dpu-Mir-9-P9 Dsi-Mir-9-P9 Dya-Mir-9-P9 Eba-Mir-9 Egr-Mir-9 Esc-Mir-9 Gsa-Mir-9 Gsp-Mir-9 Hme-Mir-9-P9 Hmi-Mir-9 Hru-Mir-9 Isc-Mir-9 Lan-Mir-9 Lgi-Mir-9 Llo-Mir-9 Mom-Mir-9 Npo-Mir-9 Obi-Mir-9 Ofu-Mir-9 Ovu-Mir-9 Pau-Mir-9 Pdu-Mir-9 Pmi-Mir-9 Pve-Mir-9 Rph-Mir-9 Sma-Mir-9 Snu-Mir-9 Spu-Mir-9 Tca-Mir-9-P9a Tca-Mir-9-P9b-v1 Tca-Mir-9-P9c-v1 War-Mir-9 Xbo-Mir-9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087241.1: 4526129-4526188 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-9-P9) |
Mir-3
NC_087241.1: 4525806-4525867 [-]
Ensembl
Mir-2-P5 NC_087241.1: 4525982-4526042 [-] Ensembl Mir-9-P9 NC_087241.1: 4526129-4526188 [-] Ensembl Mir-279-P1 NC_087241.1: 4526260-4526323 [-] Ensembl Mir-36 NC_087241.1: 4526388-4526443 [-] Ensembl Mir-3478 NC_087241.1: 4526391-4526444 [+] Ensembl |
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| Seed | CUUUGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGACUCCAGUUAAAGAGUCUCAUUGGGAUUUCUUUGGUGAUCUAACUGAUUGGUGAGAUUUAUAUUCCUAAAGCUAGAUCAGCGAGGUAACCCCGGUGAGACAUAUCAUCAGUUACUUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGACUCCAGUUAAAGAG--| A U G A GAUU UGAGAU UCUCAUUGGG UU CUUUG UGAUCUA CU GG \ AGAGUGGCCC AA GGAGC ACUAGAU GA CC U ACUUCAUUGACUACUAUAC^ C U G C AAU- UUAUAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dlo-Mir-9-P9_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUUUGGUGAUCUAACUGAUUGGU -24
Get sequence
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| Star sequence | Dlo-Mir-9-P9_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UAAAGCUAGAUCAGCGAGGUAA -60
Get sequence
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