| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-9-P12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-9 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dlo-Mir-9-P9 Dlo-Mir-9-P10 Dlo-Mir-9-P13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-9-P12-v1 Aga-Mir-9-P12 Agr-Mir-9 Bfl-Mir-9 Bge-Mir-9-P12-v1 Bko-Mir-9 Bla-Mir-9 Bpl-Mir-9 Cin-Mir-9 Cte-Mir-9 Dan-Mir-9-P12-v1 Dgr-Mir-9 Dme-Mir-9-P12-v1 Dmo-Mir-9-P12-v1 Dsi-Mir-9-P12-v1 Dya-Mir-9-P12-v1 Eba-Mir-9 Egr-Mir-9 Esc-Mir-9 Gpa-Mir-9-P12-v1 Gsa-Mir-9 Gsp-Mir-9 Hme-Mir-9-P12 Hmi-Mir-9 Hru-Mir-9 Isc-Mir-9 Lan-Mir-9 Lgi-Mir-9 Llo-Mir-9 Mom-Mir-9 Npo-Mir-9 Obi-Mir-9 Ofu-Mir-9 Ovu-Mir-9 Pau-Mir-9 Pdu-Mir-9 Pmi-Mir-9 Pve-Mir-9 Rph-Mir-9 Sma-Mir-9 Snu-Mir-9 Spu-Mir-9 Tca-Mir-9-P12 War-Mir-9 Xbo-Mir-9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087228.1: 37907-37968 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-9-P12-v1) |
Mir-9-P13
NC_087228.1: 37474-37532 [-]
Ensembl
Mir-9-P12-v1 NC_087228.1: 37907-37968 [-] Ensembl Mir-9-P12-v2 NC_087228.1: 37908-37967 [-] Ensembl Mir-306 NC_087228.1: 38072-38130 [-] Ensembl |
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| Variant | Dlo-Mir-9-P12-v1 |
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| Seed | CUUUGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCAUCACUUCAUUGCAUAGCUUUUGUCUUUUCUUUGGUAAUACAGCUCUAUGAUUAAUAGAGGAAUCUCAUAAAGCUAGAUUACCAAAGCAAAGAACAAUAGAGCUAAAUCAACACUGUCAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCAUCACUUCAUUGCAUAG- U -| U AC C UUAAUA CU UUG UCUUU CUUUGGUAAU AGCU UAUGA G GA AAC AGAAA GAAACCAUUA UCGA AUACU A UACUGUCACAACUAAAUCGA U A^ C GA A CUAAGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dlo-Mir-9-P12-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUUUGGUAAUACAGCUCUAUGA -23
Get sequence
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| Star sequence | Dlo-Mir-9-P12-v1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AUAAAGCUAGAUUACCAAAGCAA -62
Get sequence
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| Variant | Dlo-Mir-9-P12-v2 |
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| Seed | UUUGGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUCACUUCAUUGCAUAGCUUUUGUCUUUUCUUUGGUAAUACAGCUCUAUGAUUAAUAGAGGAAUCUCAUAAAGCUAGAUUACCAAAGCAAAGAACAAUAGAGCUAAAUCAACACUGUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAUCACUUCAUUGCAUAG- U -| U AC C UUAAUA CU UUG UCUUU CUUUGGUAAU AGCU UAUGA G GA AAC AGAAA GAAACCAUUA UCGA AUACU A ACUGUCACAACUAAAUCGA U A^ C GA A CUAAGG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dlo-Mir-9-P12-v2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUUGGUAAUACAGCUCUAUGA -22
Get sequence
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| Star sequence | Dlo-Mir-9-P12-v2_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AUAAAGCUAGAUUACCAAAGCA -60
Get sequence
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