| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-306 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-306 Aga-Mir-306 Bge-Mir-306 Dan-Mir-306 Dme-Mir-306 Dmo-Mir-306 Dsi-Mir-306 Dya-Mir-306 Gpa-Mir-306 Hme-Mir-306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087228.1: 38072-38130 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-306) |
Mir-9-P13
NC_087228.1: 37474-37532 [-]
Ensembl
Mir-9-P12-v1 NC_087228.1: 37907-37968 [-] Ensembl Mir-9-P12-v2 NC_087228.1: 37908-37967 [-] Ensembl Mir-306 NC_087228.1: 38072-38130 [-] Ensembl |
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| Seed | CAGGUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAUAUGCAUGUAUAUCAGUGUCUUCGAAGACAGGUACUGAGUGACUCUGAGUAUUAUCAAGUUUCUCAGGGAAACUUUGUACCCAGCUUUGAACUCACCACAGUCAACGAUGAUGAUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAAUAUGCAUGUAUAUCA--| UC ACA U GA UAUUAU GUG UUCGAAG GGUAC GAGU CUCUGAG \ CAC AAGUUUC CCAUG UUCA GGGACUC C UUAGUAGUAGCAACUGACAC^ UC GAC U AA UUUGAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dlo-Mir-306_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACAGGUACUGAGUGACUCUGAG -22
Get sequence
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| Star sequence | Dlo-Mir-306_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CAGGGAAACUUUGUACCCAGCU -59
Get sequence
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